ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RUNX1

Query protein: RUNX1
Cell class: Blood
Sort key: SRX265222 | ME-1
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RUNX1's Colocalization partners

◢ RUNX1: Average

◢ SRX6909701: 697

◢ SRX1036364: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789538: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789539: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789540: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789541: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729922: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729923: Acute myeloid leukemia

◢ SRX107295: CCRF-CEM

◢ SRX107296: CCRF-CEM

◢ SRX029435: CD34+

◢ SRX062339: CD34+

◢ SRX248935: CD34+

◢ SRX212443: CD4+ T cells

◢ SRX212444: CD4+ T cells

◢ SRX029081: CMK

◢ SRX369126: CUTLL1

◢ SRX1089834: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX1089835: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX3434294: HL-60

◢ SRX1041800: Jurkat

◢ SRX1492212: Jurkat

◢ SRX2014504: Jurkat

◢ SRX206835: Jurkat

◢ SRX015826: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128782: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128783: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128784: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX029083: K-562

◢ SRX029085: K-562

◢ SRX062335: Kasumi-1

◢ SRX062336: Kasumi-1

◢ SRX062337: Kasumi-1

◢ SRX062338: Kasumi-1

◢ SRX112544: Kasumi-1

◢ SRX112545: Kasumi-1

◢ SRX1514291: Kasumi-1

◢ SRX259611: Kasumi-1

◢ SRX259612: Kasumi-1

◢ SRX259621: Kasumi-1

◢ SRX259622: Kasumi-1

◢ SRX747571: Kasumi-1

◢ SRX858324: Kasumi-1

◣ SRX265222: ME-1

◢ SRX3030205: ME-1

◢ SRX3030206: ME-1

◢ SRX4393711: ME-1

◢ SRX4393712: ME-1

◢ SRX5567179: ME-1

◢ SRX5567180: ME-1

◢ SRX3586353: NALM-6

◢ SRX3586355: NALM-6

◢ SRX1803059: NB-4

◢ SRX2963102: PBMC

◢ SRX1036365: Peripheral blood stem cells

◢ SRX3586365: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586366: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586367: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX202967: SEM

◢ SRX063913: SKNO-1

◢ SRX1261520: TF-1

◢ SRX1261521: TF-1

◢ SRX1261522: TF-1

◢ SRX212442: Treg

◢ SRX682384: TSU-1621MT

◢ SRX952434: U-937

◢ RUNX1: STRING

ME-1
 SRX265222
RUNX1
Kasumi-1
 SRX3098195
RUNX1T1
Pre-leukemia stem cells
 SRX1735651
FOXO1
Kasumi-1
 SRX3098193
RUNX1T1
Peripheral blood stem cells
 SRX1036365
RUNX1
Kasumi-1
 SRX3098196
RUNX1T1
SEM
 SRX1873451
MED1
Jurkat
 SRX2711485
USP7
Jurkat
 SRX2711484
USP7
SKNO-1
 SRX063913
RUNX1
SEM
 SRX2281252
KMT2A
SEM
 SRX4484988
ERG
ME-1
 SRX265225
TCF12
ME-1
 SRX265230
ERG
PBMC
 SRX2963102
RUNX1
NAMALWA
 SRX389278
NRF1
MM.1S
 SRX366792
BRD3
Jurkat
 SRX2513052
TET2
Jurkat
 SRX2513053
TET2
GM12878
 SRX150389
NRF1
ME-1
 SRX265219
CBFB
Cord blood mononuclear
 SRX2281258
KMT2A
MM.1S
 SRX1726514
TFDP1
MM.1S
 SRX244178
MED1
BJAB
 SRX2059875
SUPT5H
MV-4-11
 SRX1293531
KMT2A
TSU-1621MT
 SRX682379
RARA
TSU-1621MT
 SRX682375
ERG
Erythroblasts
 SRX4046307
MEN1
CUTLL1
 SRX3433645
USP7
U-937
 SRX117010
FLI1
MOLT-4
 SRX2314264
SUPT5H
MM.1S
 SRX1726515
E2F1
Acute promyelocytic leukemia
 SRX026657
ERG
ME-1
 SRX265227
TAL1
Bone marrow mononuclear cells
 SRX2281260
KMT2A
K-562
 SRX4708082
RBFOX2
K-562
 SRX3852900
NELFE
K-562
 SRX3852892
NELFE
K-562
 SRX3852891
NELFE
K-562
 SRX3852890
NELFA
Th1 Cells
 SRX1460848
RELA
K-562
 SRX100430
HEY1
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX026653
ERG
GM12878
 SRX100541
ELF1
K-562
 SRX3852898
NELFA
OCI-LY1
 SRX275409
E2F1
P493-6
 SRX129082
MAX
K-562
 SRX3852899
NELFE
K-562
 SRX3852895
NELFA
K-562
 SRX063921
ERG
ME-1
 SRX265229
ELF1
SEM
 SRX2281249
KMT2A
K-562
 SRX186645
RBBP5
K-562
 SRX116442
RBBP5
CUTLL1
 SRX3433644
USP7
SEM
 SRX1873447
KDM2B
U-937
 SRX117011
FLI1
MV-4-11
 SRX1134739
BRD4
ME-1
 SRX265218
CBFB
MV-4-11
 SRX1134766
BRD4
MV-4-11
 SRX1134743
BRD4
K-562
 SRX063920
ERG
HL-60
 SRX3934085
INTS13
HL-60
 SRX3345955
INTS13
THP-1
 SRX6913056
BRD2
THP-1
 SRX6913055
BRD2
B-CLL cells
 SRX3591434
BRD4
MM.1S
 SRX204905
BRD4
K-562
 SRX186646
PHF8
P493-6
 SRX129083
MAX
K-562
 SRX116437
PHF8
K-562
 SRX116436
PHF8
Thymus
 SRX1046558
RAG2
GM12878
 SRX100479
EGR1
K-562
 SRX063922
ERG
Jurkat
 SRX3934088
INTS13
HL-60
 SRX3934087
INTS13
CUTLL1
 SRX369136
BRD4
HL-60
 SRX3345956
INTS13
HL-60
 SRX3345954
INTS13
P493-6
 SRX204413
MAX
K-562
 SRX186782
KDM5B
GM12878
 SRX150363
MAZ
P493-6
 SRX129084
MAX
K-562
 SRX116438
KDM5B
MV-4-11
 SRX1134763
BRD4
THP-1
 SRX6913057
BRD2
THP-1
 SRX6913054
BRD2
B-CLL cells
 SRX3591431
BRD4
K-562
 SRX100491
YY1
K-562
 SRX100539
ELF1
K-562
 SRX150626
CCNT2
K-562
 SRX150623
HMGN3
Multiple Myeloma
 SRX129116
MYC
GM12891
 SRX100580
YY1
GM12892
 SRX100561
YY1
GM12878
 SRX100451
YY1
P493-6
 SRX1539275
MYC
SEM
 SRX2281247
KMT2A
RAMOS
 SRX5346116
MYC
B-CLL cells
 SRX3591435
BRD4
P493-6
 SRX5307507
MAX
GM12892
 SRX100379
PAX5
ME-1
 SRX265224
TBP
K-562
 SRX150417
MAZ
SEM
 SRX1424886
CXXC1
K-562
 SRX100514
E2F6
P493-6
 SRX129066
MYC
ME-1
 SRX265220
MYH11
K-562
 SRX150595
MYC
P493-6
 SRX129068
MYC
OCI-LY1
 SRX1787312
KDM2B
K-562
 SRX1091814
CTCFL
K-562
 SRX150424
MAX
K-562
 SRX100515
YY1
Dendritic Cells
 SRX1614811
ZNF366
K-562
 SRX150676
E2F6
K-562
 SRX063919
ERG
K-562
 SRX100518
ZBTB7A
ME-1
 SRX265231
SPI1
delta-47
 SRX1091818
CTCFL
HUDEP-2
 SRX3161009
ZBTB7A
K-562
 SRX103009
MYC
K-562
 SRX100459
EGR1
K-562
 SRX150721
UBTF
HUDEP-2
 SRX3161011
ZBTB7A
K-562
 SRX100446
CTCFL
ME-1
 SRX5567179
RUNX1
ME-1
 SRX4393711
RUNX1
Kasumi-1
 SRX236112
RUNX1T1
Kasumi-1
 SRX1514291
RUNX1
MV-4-11
 SRX2375362
CDK9
MOLT-4
 SRX1637463
BRD4
OCI-LY1
 SRX689472
BCOR
Jurkat
 SRX1880278
BRD4
U-937
 SRX265238
CBFB
MOLT-4
 SRX2314265
SUPT5H
Kasumi-1
 SRX1514280
TAL1
MOLT-4
 SRX2314263
SUPT5H
MOLT-4
 SRX2314262
SUPT5H
MM.1S
 SRX327755
MED1
Erythroblasts
 SRX4046302
CXXC1
OCI-LY1
 SRX398294
MED1
MM.1S
 SRX204906
MED1
Th1 Cells
 SRX1460849
AFF4
MM.1S
 SRX244180
CDK9
K-562
 SRX6913072
BRD2
K-562
 SRX100476
TAF1
Acute myeloid leukemia
 SRX3789539
RUNX1
IMS-M2
 SRX5668135
KMT2A
MM.1S
 SRX327758
CDK9
MM.1S
 SRX244177
CDK9
K-562
 SRX186630
HCFC1
GM12878
 SRX100582
TAF1
CD4+ T cells
 SRX6913100
BRD4
Peripheral blood mononuclear cells
 SRX4212578
EZH2
B-CLL cells
 SRX3591438
BRD4
Th1 Cells
 SRX1460852
BRD4
OCI-LY-7
 SRX971780
KMT2D
OCI-AML3
 SRX5668141
KMT2A
Erythroblasts
 SRX4046308
RBBP5
CD4+ T cells
 SRX6913099
BRD4
PBMC
 SRX5007091
BCL11B
OCI-LY1
 SRX398293
BRD4
Lymphoblastoid cell line
 SRX2867628
BRD4
K-562
 SRX4708090
GTF2F1
MM.1S
 SRX327757
MED1
Monocytes
 SRX3934096
INTS13
HL-60
 SRX3345953
INTS13
K-562
 SRX6913085
BRD2
K-562
 SRX150679
E2F4
K-562
 SRX150574
TBP
SKNO-1
 SRX063912
CBFB
Erythroid Cells
 SRX218421
EP300
Jurkat
 SRX398095
CDK7
Monocytes
 SRX3934095
INTS13
Thymus
 SRX1968078
BCL11B
K-562
 SRX100487
ETS1
Jurkat
 SRX3934089
INTS13
IMS-M2
 SRX5668134
KMT2A
K-562
 SRX6913076
BRD3
CUTLL1
 SRX515115
KDM6B
B-CLL cells
 SRX3591433
BRD4
K-562
 SRX6913074
BRD2
MV-4-11
 SRX1293534
PSIP1
K-562
 SRX4708081
FIP1L1
Akata
 SRX2795371
BRD4
Th1 Cells
 SRX1460851
BRD4
MOLM-14
 SRX1287856
BRD4
MV-4-11
 SRX1134769
BRD4
K-562
 SRX6913091
BRD4
THP-1
 SRX6913050
BRD4
THP-1
 SRX6913045
BRD4
THP-1
 SRX6913042
BRD3
K-562
 SRX4708083
RBM22
Peripheral blood mononuclear cells
 SRX4212591
EZH2
K-562
 SRX100570
SIN3A
THP-1
 SRX6913062
BRD4
THP-1
 SRX6913048
BRD4
Peripheral blood mononuclear cells
 SRX4212572
EZH2
Lymphoblastoid cell line
 SRX4046314
CXXC1
Erythroid Cells
 SRX1042049
USF1
K-562
 SRX3852897
NELFA
P493-6
 SRX204410
BRD4