ChIP-Atlas: Colocalization analysis

Colocalization analysis for RUNX1

Query protein: RUNX1
Cell class: Blood
Sort key: SRX212442 | Treg
 
Color legends
ChIP-seq data:  H-H H-M M-M H-L M-L L-L N.D. Same  (Peak intensities are High, Middle or Low)

STRING data:  1000 750 500 250 0 N.D.  (Values = STRING's binding scores)

Downloads: TSV (text), GML (Cytoscape)
Links: Movie and Document for ChIP-Atlas Colocalization
Cell types  Exp. IDs RUNX1's Colocalization partners

◢ RUNX1: Average

◢ SRX6909701: 697

◢ SRX1036364: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789538: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789539: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789540: Acute myeloid leukemia

◢ SRX3789541: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729922: Acute myeloid leukemia

◢ SRX5729923: Acute myeloid leukemia

◢ SRX107295: CCRF-CEM

◢ SRX107296: CCRF-CEM

◢ SRX029435: CD34+

◢ SRX062339: CD34+

◢ SRX248935: CD34+

◢ SRX212443: CD4+ T cells

◢ SRX212444: CD4+ T cells

◢ SRX029081: CMK

◢ SRX369126: CUTLL1

◢ SRX1089834: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX1089835: Hematopoietic Stem Cells

◢ SRX3434294: HL-60

◢ SRX1041800: Jurkat

◢ SRX1492212: Jurkat

◢ SRX2014504: Jurkat

◢ SRX206835: Jurkat

◢ SRX015826: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128782: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128783: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX128784: Jurkat (Clone E6-1)

◢ SRX029083: K-562

◢ SRX029085: K-562

◢ SRX062335: Kasumi-1

◢ SRX062336: Kasumi-1

◢ SRX062337: Kasumi-1

◢ SRX062338: Kasumi-1

◢ SRX112544: Kasumi-1

◢ SRX112545: Kasumi-1

◢ SRX1514291: Kasumi-1

◢ SRX259611: Kasumi-1

◢ SRX259612: Kasumi-1

◢ SRX259621: Kasumi-1

◢ SRX259622: Kasumi-1

◢ SRX747571: Kasumi-1

◢ SRX858324: Kasumi-1

◢ SRX265222: ME-1

◢ SRX3030205: ME-1

◢ SRX3030206: ME-1

◢ SRX4393711: ME-1

◢ SRX4393712: ME-1

◢ SRX5567179: ME-1

◢ SRX5567180: ME-1

◢ SRX3586353: NALM-6

◢ SRX3586355: NALM-6

◢ SRX1803059: NB-4

◢ SRX2963102: PBMC

◢ SRX1036365: Peripheral blood stem cells

◢ SRX3586365: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586366: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX3586367: Pre-B lymphoblast cells

◢ SRX202967: SEM

◢ SRX063913: SKNO-1

◢ SRX1261520: TF-1

◢ SRX1261521: TF-1

◢ SRX1261522: TF-1

◣ SRX212442: Treg

◢ SRX682384: TSU-1621MT

◢ SRX952434: U-937

◢ RUNX1: STRING

Treg
 SRX212442
RUNX1
Erythroid progenitors
 SRX687554
HDAC1
Jurkat
 SRX206835
RUNX1
697
 SRX6909698
MED1
Erythroblasts
 SRX646126
SUZ12
Erythroid progenitors
 SRX687556
GATA2
Macrophages
 SRX5839977
CREBBP
ICN1
 SRX625673
IKZF1
RAMOS
 SRX1212540
TCF3
Macrophages
 SRX5839978
CREBBP
Erythroblasts
 SRX646134
EZH2
Erythroblasts
 SRX646125
EED
CD34+
 SRX386204
GFI1B
K-562
 SRX3768264
USF2
KG-1
 SRX3599221
EZH2
OCI-LY1
 SRX3461647
KDM1A
THP-1
 SRX2900591
NCOA2
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778399
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778398
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778397
YY1
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778388
YY1
THP-1
 SRX2319760
VDR
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089828
NFE2
ICN1
 SRX625677
IKZF1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089825
TAL1
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089824
GATA1
GM12878
 SRX475791
EP300
Macrophages
 SRX5839979
CREBBP
MV-4-11
 SRX4170731
WDR5
MV-4-11
 SRX4170729
WDR5
MV-4-11
 SRX4170728
WDR5
MV-4-11
 SRX4170725
WDR5
MV-4-11
 SRX4170724
WDR5
MV-4-11
 SRX4170723
WDR5
Th17 Cells
 SRX965494
STAT3
GM04604
 SRX8066535
CTCF
GM04648
 SRX8066533
CTCF
GM06077
 SRX8066531
CTCF
K-562
 SRX7494163
HIF1A
THP-1
 SRX728776
LEO1
THP-1
 SRX728768
PAF1
Jurkat
 SRX697746
PRKCQ
Jurkat
 SRX697745
PRKCQ
Jurkat
 SRX697744
PRKCQ
Jurkat
 SRX697743
PRKCQ
SU-DHL-6
 SRX6430594
EZH2
ICN1
 SRX625676
IKZF1
CUTLL1
 SRX515116
KDM6B
SEM
 SRX4931277
ELL2
SEM
 SRX4931276
AFF4
U-937
 SRX4705118
CHAF1A
U-937
 SRX4705117
CHAF1A
U-937
 SRX4705114
CHAF1A
Erythroblasts
 SRX467201
NR2C2
Erythroblasts
 SRX467200
NR2C2
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768715
MLLT3
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768714
MLLT3
ALL xenograft
 SRX3636820
NR3C1
THP-1
 SRX360404
VDR
THP-1
 SRX360403
VDR
THP-1
 SRX360402
VDR
B cells
 SRX3445723
ZNF341
B cells
 SRX3445722
ZNF341
HL-60
 SRX3434295
SKI
OCI-LY-10
 SRX3387558
STAT3
TMD8
 SRX3387556
STAT3
TMD8
 SRX3387555
STAT3
HAP1
 SRX3312899
MTHFD1
HAP1
 SRX3312898
MTHFD1
HAP1
 SRX3312897
MTHFD1
HAP1
 SRX3312896
MTHFD1
HAP1
 SRX3312887
BRD4
HAP1
 SRX3312885
BRD4
HAP1
 SRX3312884
BRD4
OCI-LY1
 SRX3135180
BCL6
SET-2
 SRX2961560
STAT1
SET-2
 SRX2961559
STAT1
CD4+ T cells
 SRX2821737
FOSL1
Akata
 SRX2795369
BRD4
Akata
 SRX2795367
BRD4
Mutu
 SRX2795365
BRD4
Mutu
 SRX2795363
BRD4
THP-1
 SRX2754627
GABPA
THP-1
 SRX2754626
GABPA
Jurkat
 SRX2730808
ARID5B
OCI-LY1
 SRX271857
EZH2
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614802
DNMT3B
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614801
DNMT3B
MOLM-13
 SRX2546006
METTL14
MOLM-13
 SRX2546005
METTL14
MOLM-13
 SRX2546004
METTL14
MOLM-13
 SRX2546001
METTL3
SKNO-1
 SRX1942893
ASXL2
Mutu
 SRX1923325
BRD3
Mutu
 SRX1923320
BRD4
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089831
IRF2
K-562
 SRX1085072
KDM2B
HPB-ALL
 SRX1085070
KDM2B
DND-41
 SRX1085069
KDM2B
Macrophages
 SRX1023797
SPI1
THP-1
 SRX1304582
LYL1
K-562
 SRX3768263
USF2
THP-1
 SRX2900590
NCOA2
Lymphoblastoid cell line
 SRX2778389
YY1
K-562
 SRX1431735
SPI1
MOLM-14
 SRX5242459
MED1
KG-1
 SRX3599220
EZH2
THP-1
 SRX2900594
NCOA2
SU-DHL-6
 SRX271858
EZH2
NOMO-1
 SRX1642494
BRD9
THP-1
 SRX728790
CDK12
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614803
DNMT3B
B Lymphoblastoid cell line
 SRX2614800
DNMT3B
NALM-6
 SRX3586355
RUNX1
Pre-B ALL 
 SRX625678
IKZF1
CD4+ T cells
 SRX4345362
FOS
PBMC
 SRX3942990
ZNF341
MV-4-11
 SRX4170733
WDR5
MV-4-11
 SRX4170732
WDR5
CTV-1
 SRX5574474
SPI1
CTV-1
 SRX5574473
SPI1
K-562
 SRX7494164
HIF1A
MOLM-13
 SRX4705112
CHAF1A
Lymphoblastoid cell line
 SRX4046315
CXXC1
T cells
 SRX3942992
ZNF341
PBMC
 SRX3942989
ZNF341
OCI-LY-10
 SRX3387557
STAT3
Akata
 SRX2795368
BRD4
Akata
 SRX2795366
BRD4
Pfeiffer
 SRX271860
EZH2
Th17 Cells
 SRX2661479
STAT3
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089827
TAL1
Erythroid progenitors
 SRX5169134
GATA2
Hematopoietic Stem Cells
 SRX1089823
GATA1
GM12878
 SRX475789
EP300
MV-4-11
 SRX4170730
WDR5
MV-4-11
 SRX4170727
WDR5
MV-4-11
 SRX4170726
WDR5
MV-4-11
 SRX4170722
WDR5
HB1119
 DRX059612
KMT2B
HB1119
 DRX059610
CBX8
THP-1
 SRX728789
CDK12
KBM-7
 SRX6840508
HAP1
MOLM-14
 SRX5242460
MED1
Jurkat
 SRX4705119
CHAF1A
Jurkat
 SRX392798
REST
HAP1
 SRX3312886
BRD4
OCI-AML3
 SRX3263401
CEBPB
OCI-LY1
 SRX3135181
BCL6
SET-2
 SRX2961558
STAT1
THP-1
 SRX2900589
NCOA2
THP-1
 SRX2900584
NR3C1
CD4+ T cells
 SRX2821736
FOSL1
WSU-DLCL2
 SRX271859
EZH2
Mutu
 SRX1923324
BRD3
Chronic myelomonocytic leukemia
 ERX2277486
CSF1R
Macrophages
 ERX2277476
CSF1R
HB1119
 DRX059613
TAF1C
HB1119
 DRX059609
BMI1
HB1119
 DRX059608
AFF1
HB1119
 DRX059607
MLLT6
Lymphoblastoid cell line
 SRX472275
TERF1
KG-1
 SRX3599225
SUZ12
GEN2.2
 SRX1491263
BRD4
Th17 Cells
 SRX2661481
STAT3
DND-41
 SRX186718
EZH2
ALL-SIL
 SRX1085073
KDM2B
REH
 SRX1085065
KDM2B
ME-1
 SRX3030205
RUNX1
THP-1
 SRX5503143
STAT2
SEM
 SRX4931274
ELL2
Erythroblasts
 SRX3768721
MLLT3
THP-1
 SRX2900585
NR3C1
CD4+ T cells
 SRX2821738
FOSL1
MOLM-13
 SRX2546003
METTL14
CD34+
 SRX029437
TAL1
CTV-1
 SRX5574477
SPI1
K-562
 SRX1431734
SPI1
K-562
 SRX895430
SUMO2
RAMOS
 SRX5346123
MYC
RAMOS
 SRX5346122
MYC
SEM
 SRX4931273
AFF4
Lymphoblastoid cell line
 SRX472276
TERF2
HEL
 SRX3837516
SRF
CD34 Hematopoietic stem cells
 SRX3768713
MLLT3
Monocytes
 SRX3586327
NR3C1
OCI-LY1
 SRX3461646
KDM1A
BCBL1
 SRX3082736
ZIC2
CD4+ T cells
 SRX212440
ETS1
Mutu
 SRX1923321
BRD4
NOMO-1
 SRX1642495
BRD9
RAMOS
 SRX5346124
MYC
HEL
 SRX3837517
SRF
THP-1
 SRX2900595
NCOA2
THP-1
 SRX2900592
NCOA2
GM12878
 SRX2837385
REL
CD4+ T cells
 SRX237290
SRCAP
Mutu
 SRX1923323
BRD2
P493-6
 SRX129067
MYC
Monocytes
 ERX2277488
CSF1R
Macrophages
 ERX2277468
CSF1R
HB1119
 DRX059611
DOT1L
THP-1
 SRX5141103
IRF8
GM12878
 SRX749133
BRD4
THP-1
 SRX5503140
STAT1