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Budding yeast cDNA sequencing project
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
Budding yeast cDNA sequencing project
名称の読み方
-
別名
-
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00838-000
作成者
作成氏名
三浦 史仁
作成者英名
Fumihito Miura
作成者所属
東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻(作成時)
作成氏名
伊藤 隆司*
作成者英名
Takashi Ito
作成者所属
東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻(作成時)
連絡先

〒277-8561 千葉県柏市柏の葉5-1-5
東京大学基盤棟CB-06
東京大学 大学院理学系研究科 生物化学専攻
TEL 04-7136-3989
FAX 04-7136-3979
E-mail :

データベース分類

ゲノムデータベース(脊椎動物以外)-真菌ゲノムデータベース

生物種
Taxonomy Name
Saccharomyces cerevisiae
Taxonomy ID
データベースの説明

Vector-capping methodによる出芽酵母完全長cDNAライブラリーから作成した完全長cDNAクローンの5'末端配列、及びPhredソフトウェアによる配列クオリティ値

データベースの特長・有用性・活用方法

Vector-capping methodによってcDNAの5'端の完全性が確認可能であるから、ゲノムにマッピングすることによって、正確な転写開始点を知ることができる。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
文部科学省 科学研究費補助金 特定領域研究
名称
科学技術振興機構 バイオインフォマティクス推進事業
論文等
文献名
A large-scale full-length cDNA analysis to explore the budding yeast transcriptome.
著者名
Miura F, Kawaguchi N, Sese J, Toyoda A, Hattori M, Morishita S, Ito T.
雑誌名/掲載年月/号
Proc Natl Acad Sci U S A. 2006 Nov 21;103(47):17846-51.
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所
オリジナルサイト
http://itolab.med.kyushu-u.ac.jp/GCap/
運用開始年月日
2006/11/14
最終更新年月日
2006/11/14
統括サイト
-
データの一括ダウンロードサイト
http://itolab.med.kyushu-u.ac.jp/GCap/download.html
参照先データベース

-

一覧表示
無し
クエリ検索
無し
Webサービス
無し
WebサービスURL
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