TMFunction
このデータベースについて
データベースの説明
| データベース全般 | |
名称
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TMFunction
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名称の読み方
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ティーエムファンクション |
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別名
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Functional Database of Membrane Proteins |
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00714-000 |
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作成者
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作成氏名
グロミハ マイケル*  
作成者英名
Michael Gromiha
作成者所属
インド工科大学マドラス校
作成者の文献検索
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連絡先
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Dr. M. MICHAEL GROMIHA Associate Professor Department of Biotechnology IIT Madras Chennai - 600 036 Tel: +91-44-2257-4138(O) 
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データベース分類
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構造データベース-タンパク質構造 |
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データベースの説明
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TMFunctionは、α-ヘリックス及びβ-バレル型膜タンパク質に含まれる機能的残基のデータベースです。各タンパク質の名称と由来はUniProtで同定していますが、PDBとも関連づけられるものは、そのIDを示しています。このデータベースには様々な実験手法やパラメータ（例えば、"affinity", "dissociation constant", "IC50", "activity"など）が含まれています。また、タンパク質中の各残基（またはその変異）には、計算または実験によって得られた数値が付与されています。このデータベースで用いた実験データは、ジャーナルの調査及びPubMedのキーワード検索によって得られた文献から収集したものです。さらに完全な参照情報（ジャーナルの引用とPubMed ID）も、このデータベースには含まれています。 |
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データベースの特長・有用性・活用方法
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TMFuoctionは、配列データベース(UniProt)、立体構造データベース(PDB)、文献データベース(PubMed)を橋渡ししています。 |
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データベースの利用許諾
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CC 表示-継承 詳細 |
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予算的背景・プロジェクト
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論文等
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文献名
TMFunction: database for functional residues in membrane proteins.
著者名
Gromiha MM, Yabuki Y, Suresh MX, Thangakani AM, Suwa M, Fukui K.
雑誌名/掲載年月/号
Nucleic Acids Res. 2009 Jan;37(Database issue)
外部リンク
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| データベースのオリジナルサイト情報 | |
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データベース運用場所
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産業技術総合研究所 臨海副都心センター |
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オリジナルサイト
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（運用終了） http://tmbeta-genome.cbrc.jp/TMFunction/ |
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運用開始年月日
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2007/7 |
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最終更新年月日
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2008/9 |
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統括サイト
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データの一括ダウンロードサイト
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参照先データベース
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UniProt, PDB, PubMed |
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一覧表示
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有り |
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クエリ検索
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有り |
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Webサービス
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無し |
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WebサービスURL
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ユーザ登録
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無し |