このデータベースについて
TMFunctionデータ
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データ名
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TMFunctionデータ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00714-001 |
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データ内容の説明
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TMFunctionは、α-ヘリックス及びβ-バレル型膜タンパク質に含まれる機能的残基のデータベースです。各タンパク質の名称と由来はUniProtで同定していますが、PDBとも関連づけられるものは、そのIDを示しています。このデータベースには様々な実験手法やパラメータ（例えば、"affinity", "dissociation constant", "IC50", "activity"など）が含まれています。また、タンパク質中の各残基（またはその変異）には、計算または実験によって得られた数値が付与されています。このデータベースで用いた実験データは、ジャーナルの調査及びPubMedのキーワード検索によって得られた文献から収集したものです。さらに完全な参照情報（ジャーナルの引用とPubMed ID）も、このデータベースには含まれています。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
tmfunction.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
48.5 KB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/tmfunction | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データ取得方法
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UniProt, PDB, PubMed |
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解析方法
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- |
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データ件数
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2,907 件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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