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このデータベースについて

Sequence Collection

データ説明
データ名
Sequence Collection
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00713-001
データ内容の説明
β-バレル型膜タンパク質の予測を行ったゲノムの一覧。 複数の染色体があるゲノムは、染色体ごとにエントリを分けている。
データファイル
データファイル名 :
tmbeta_genome_sequence_collection.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
8.8 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/tmbeta_genome_sequence_collection
データ取得方法

古細菌23セット、細菌237セット、真核生物15セットの計275セットの解読が完了したゲノム情報をNCBIから取得。

解析方法

-

データ件数

427 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Sequence Collection ID

独自にゲノムに付与した通し番号

Classification

生物分類(Archaea、Bacteria、またはEukaryota)

Organism Name

生物種名。複数の染色体を持つ生物は染色体番号も含む。

Locus

ゲノム配列のRefSeq ID

FASTA File

ゲノム配列が記載されたFASTAファイル