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このデータベースについて

タンパク質基本情報

データ説明
データ名
タンパク質基本情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01193-001
データ内容の説明
アミノ酸配列やRefSeq IDなど、モデリング対象タンパク質の基本情報
データファイル
データファイル名 :
sahg_protein.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
8.1 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/sahg_protein
データ取得方法

RefSeq (NCBI Reference Sequence Database)から取得。その他、EzCatDB (A Database of Enzyme Catalytic Mechanisms), Human Protein Reference Database (HPRD), UniProtKB/Swiss-Protの各データベースへの配列検索結果を取得。

解析方法

-

データ件数

24,878 件

データ詳細
項目名 項目の説明
RefSeqID

RefSeq ID

domainSize

リンクしているドメインモデリングの数

Link to Domain

(簡易検索ページのみ)同一RefSeqIDのドメインモデリングへのリンク

Link to Complex

(簡易検索ページのみ)同一RefSeqIDの複合体モデリングへのリンク

GeneID

タンパク質をコードする遺伝子Entrez Gene ID

Definition

RefSeqに記述されているタンパク質名称

chromosome

タンパク質をコードする遺伝子が存在する染色体番号

Location

タンパク質をコードする遺伝子の遺伝子座

Sequence

アミノ酸配列

EC number

EC番号

EzCatDB

EzCatDB ID

HPRD

HPRD ID

Swiss-Prot

(簡易検索ページのみ)UniProtKB/Swiss-Protへのリンク