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このデータベースについて

シーケンサ情報

データ説明
データ名
シーケンサ情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00191-003
データ内容の説明
気相プロティンシーケンサーで決定したアミノ酸配列について、Blast検索により相同検索した結果の一覧です。
データファイル
データファイル名 :
rpd_sequencer.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
23 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rpd_sequencer
データ取得方法

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解析方法

気相プロティンシーケンサーで決定したアミノ酸配列をクエリとし、生物種をOryza sativaに限定したNRデータベースでBlast検索を行いました。
このBlast検索には、ncbi-blast-2.2.28と、2013年10月時点のNRデータベースを使用しています。

データ件数

3,376 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Spot ID

スポットID

Amino sequence

アミノ酸配列

Homologous Protein Accession No.

相同なタンパク質のアクセション番号

Homologous Protein definition

相同なタンパク質のdefinition

Homologous search identities (%)

相同性検索のidentifies