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生命科学系データベースアーカイブ
RMOS

8987Array-Chromosome

データ説明

info データ名 8987Array-Chromosome
info DOI 
info データ内容の説明 

Rice8987 Array（f_array）のクローンの染色体上の位置情報リスト

info データファイル 
データファイル名:
rmos_8987array_chromosome.csv.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/rmos/LATEST/rmos_8987array_chromosome.csv.zip
ファイルサイズ:
96.5 KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 -
info 解析方法 -
info データ件数 

9,105 件

データ詳細

項目名項目の説明
f_array_element f_array エレメント番号
(アレイgrass上の位置情報：「アレイパターンとクローン配置」参照)
Accession1 DDBJアクセッション番号 1
Accession2 DDBJアクセッション番号 2
Clone name クローン名
DDBJ name DDBJのDefinitionに記載された名
Multi クローン配列に類似性が高いゲノム配列が複数あるものについて、クローン配列と類似性の高いものからA, B・・の順に記載
Mapping

D : クローン配列を直接ゲノムへマッピング
G : 類似配列グループの代表クローン配列をゲノムへマッピング
Chr. クローン配列と類似性の高いゲノム配列の存在する染色体番号
Clone name (group) グループの代表クローン名
Multi (group) グループの代表クローン配列に類似性が高いゲノム配列が複数あるものについて、代表クローン配列と類似性の高いものからA, B・・の順に記載
Chr. (group) グループの代表クローン配列と類似性の高いゲノム配列の存在する染色体番号