tRNA

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tRNA

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データ内容の説明

下記の内容のデータです。

イネミトコンドリアゲノムで同定した、17種のアミノ酸の23個のtRNA配列の一覧
イネと、シロイヌナズナ(Arabidopsis)、サトウダイコン(Sugar beet)の3種類の植物の間で、イネミトコンドリアゲノムに存在している遺伝子が、他の植物のミトコンドリアゲノムに存在するかどうか、その状況の違いを整理した一覧

データファイル

データファイル名:

rmg_trna.zip

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1 KB

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データ取得方法

本データベース中の「Entire Sequence」データ

解析方法

データ件数

21 件

項目名	項目の説明
Amino acids	tRNAが受容するアミノ酸
tRNA	tRNA遺伝子名においてtrnに続くアミノ酸略称
rice	イネ +: ｔRNAあり -: ｔRNAなし y: 偽遺伝子 a: ミトコンドリアtRNA b: 色素体由来tRNA trnPとtrnRが偽遺伝子であることは Miyata et al. (1998) からの引用
Arabidopsis	シロイヌナズナ +: ｔRNAあり -: ｔRNAなし y: 偽遺伝子 a: ミトコンドリアtRNA b: 色素体由来tRNA 色素体由来trnY（trnY2）はtrnFから変換されたものこの項目のデータは文献 Unseld et al. (1997) からの引用
sugarbeet	サトウダイコン +: ｔRNAあり -: ｔRNAなし y: 偽遺伝子 a: ミトコンドリアtRNA b: 色素体由来tRNA c: 新規tRNA この項目のデータは文献 Kubo et al. (2000) からの引用

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