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このデータベースについて

tRNA

データ説明
データ名
tRNA
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00193-006
データ内容の説明
下記の内容のデータです。 <ul> <li>イネミトコンドリアゲノムで同定した、17種のアミノ酸の23個のtRNA配列の一覧</li> <li>イネと、シロイヌナズナ(Arabidopsis)、サトウダイコン(Sugar beet)の3種類の植物の間で、イネミトコンドリアゲノムに存在している遺伝子が、他の植物のミトコンドリアゲノムに存在するかどうか、その状況の違いを整理した一覧</li> </ul>
データファイル
データファイル名 :
rmg_trna.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
1 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rmg_trna
データ取得方法

本データベース中の「Entire Sequence」データ

解析方法

-

データ件数

21 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Amino acids

tRNAが受容するアミノ酸

tRNA

tRNA遺伝子名においてtrnに続くアミノ酸略称

rice

イネ+: tRNAあり-: tRNAなしy: 偽遺伝子a: ミトコンドリアtRNAb: 色素体由来tRNAtrnPとtrnRが偽遺伝子であることは Miyata et al. (1998) からの引用

Arabidopsis

シロイヌナズナ+: tRNAあり-: tRNAなしy: 偽遺伝子a: ミトコンドリアtRNAb: 色素体由来tRNA色素体由来trnY(trnY2)はtrnFから変換されたもの
この項目のデータは文献 Unseld et al. (1997) からの引用

sugarbeet

サトウダイコン+: tRNAあり-: tRNAなしy: 偽遺伝子a: ミトコンドリアtRNAb: 色素体由来tRNAc: 新規tRNA
この項目のデータは文献 Kubo et al. (2000) からの引用