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このデータベースについて

Plastid-like Seq in mt Genome

データ説明
データ名
Plastid-like Seq in mt Genome
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00193-004
データ内容の説明
色素体DNA配列からイネミトコンドリアゲノムに移動した断片の特徴を一覧にしたデータです。 各断片について、サイズや位置、遺伝子名、相同性と差異をまとめています。
データファイル
データファイル名 :
rmg_plastid_like_seq.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
2 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rmg_plastid_like_seq
データ取得方法

本データベース中の「Entire Sequence」データ

解析方法

-

データ件数

18 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Fragment no.

断片の番号

Position in mtDNA

ミトコンドリアDNAにおける位置

Fragment size(nt)

断片のサイズ

Position in ptDNA

色素体DNAにおける位置(位置の数値はHiratsuka et al. (1989) による)

Genes

遺伝子

Substitution

色素体DNA配列からの置換数

Deletion

色素体DNA配列からの削除数(カッコ内は削除部位の数)

Insertion

色素体DNA配列からの挿入数(カッコ内は挿入部位の数)

Homology(%)

イネ色素体配列との相同性