データベースの説明

データベース全般
名称	RGP physicalmap
名称の読み方	-
別名	Rice Genome Mapping and Sequencing Data from RGP, STAFF/NIAR, Japan
DOI	10.18908/lsdba.nbdc00318-06-000
作成者	作成氏名梅原洋佐作成者英名 Yosuke Umehara 作成者所属農業生物資源研究所作成氏名倉田のり作成者英名 Nori Kurata 作成者所属農業生物資源研究所作成氏名佐々木卓治* 作成者英名 Takuji Sasaki 作成者所属農業生物資源研究所
連絡先	〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2 国立研究開発法人農業生物資源研究所松本隆 E-mail : 片寄裕一 E-mail :
データベース分類	植物データベース-イネ
データベース分類	配列物理地図
生物種	Taxonomy Name Oryza sativa Taxonomy ID 4530
データベースの説明	RGPのDNAマーカーで選抜されたYACクローンのデータファイルを示します。RGPのイネYACライブラリーは、日本晴（Oryza sativa L. cv. Nipponbare）の培養細胞から構築され、平均挿入長350kbのクローンを6934個含んでいます。
データベースの特長・有用性・活用方法	RGPのDNAマーカーで選抜されたYACクローンのデータファイルを染色体ごとに図や表で参照することができます。表では、染色体ごとにRGPのDNAマーカーで選抜されたYACクローンを、DNAマーカー、遺伝的距離とともにまとめています。図では、染色体での区分領域ごとにYAC物理地図を示します。このアーカイブは下記の最終更新日のデータを元に作成されており、現状とは必ずしも一致しない場合があります。
データベースの利用許諾	CC 表示-継承詳細
予算的背景・プロジェクト	名称第１期イネゲノム解析研究プロジェクト（平成3～9年）
論文等	文献名 Construction and characterization of a rice YAC library for physical mapping 著者名 Yosuke Umehara, Akiko Inagaki, Hiroshi Tanoue, Yuji Yasukochi, Yoshiaki Nagamura, Shoko Saji, Yoshiaki Otsuki, Tatsuhito Fujimura, Nori Kurata, Yuzo Minobe 雑誌名/掲載年月/号 Molecular Breeding (1995) 1(1): 79-89. 外部リンク文献名 A 300 kilobase interval genetic map of rice including 883 expressed sequences 著者名 N. Kurata, Y. Nagamura, K. Yamamoto, Y. Harushima, N. Sue, J. Wu, B.A. Antonio, A. Shomura, T. Shimizu, S-Y. Lin, T. Inoue, A. Fukuda, T. Shimano, Y. Kuboki, T. Toyama, Y. Miyamoto, T. Kirihara, K. Hayasaka, A. Miyao, L. Monna, H.S. Zhong, Y. Tamura, Z-X, Wang, T. Momma, Y. Umehara, M. Yano, T. Sasaki and Y. Minobe 雑誌名/掲載年月/号 Nature Genetics (1994) 8: 365-372. 外部リンク文献名 Physical Mapping of Rice Chromosome 1 with Yeast Artificial Chromosomes (YACs) 著者名 Zi-Xuan Wang, Atsuko Idonuma, Yosuke Umehara, Wim Van Houten, Ikuo Ashikawa, Yuzo Minobe, Nori Kurata and Takuji Sasaki 雑誌名/掲載年月/号 DNA Research (1996) 3(5): 291-296. 外部リンク文献名 Yeast Artificial Chromosome Clones of Rice Chromosome 2 Ordered Using DNA Markers 著者名 Yosuke Umehara, Nori Kurata, Ikuo Ashikawa and Takuji Sasaki 雑誌名/掲載年月/号 DNA Research (1997) 4(2): 127-131. 外部リンク文献名 Ordered YAC Clone Contigs Assigned to Rice Chromosomes 3 and 11 著者名 Hiroshi Tanoue, Takanori Shimokawa, Jianzhong Wu, Norio Sue, Yosuke Umehara, Ikuo Ashikawa, Nori Kurata and Takuji Sasaki 雑誌名/掲載年月/号 DNA Research (1997) 4(2): 133-140. 外部リンク文献名 Physical Mapping of Rice Chromosomes 4 and 7 Using YAC Clones 著者名 Kazuhiro Koike, Katsuhiko Yoshino, Norio Sue, Yosuke Umehara, Ikuo Ashikawa, Nori Kurata and Takuji Sasaki 雑誌名/掲載年月/号 DNA Research (1997) 4(1): 27-33. 外部リンク文献名 Construction of YAC Contigs on Rice Chromosome 5 著者名 Shoko Saji, Yosuke Umehara, Nori Kurata, Ikuo Ashikawa and Takuji Sasaki 雑誌名/掲載年月/号 DNA Research (1996) 3(5): 297-302. 外部リンク文献名 An ordered yeast artificial chromosome library covering over half of rice chromosome 6 著者名 Y Umehara, H Tanoue, N Kurata, I Ashikawa, Y Minobe, and T Sasaki 雑誌名/掲載年月/号 Genome Research (1996) 6(10): 935-942. 外部リンク文献名 Physical mapping of rice chromosomes 8 and 9 with YAC clones 著者名 Baltazar A. Antonio, Makiko Emoto, Jianzhong Wu, Ikuo Ashikawa, Yosuke Umehara, Nori Kurata and Takuji Sasaki 雑誌名/掲載年月/号 DNA Research (1996) 3(6): 393-400. 外部リンク文献名 Assignment of YAC Clones Spanning Rice Chromosomes 10 and 12 著者名 Takanori Shimokawa, Nori Kurata, Jianzhong Wu, Yosuke Umehara, Ikuo Ashikawa and Takuji Sasaki 雑誌名/掲載年月/号 DNA Research (1996) 3(6): 401-406. 外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所	国立研究開発法人農業生物資源研究所
オリジナルサイト	（公開停止中）http://rgp.dna.affrc.go.jp/E/publicdata/physicalmap/physicalmap.html
運用開始年月日	1997/07/09
最終更新年月日	1998/08/24
統括サイト	http://rgp.dna.affrc.go.jp/
データの一括ダウンロードサイト	-
参照先データベース	DDBJ
一覧表示	有り
クエリ検索	無し
Webサービス	無し
WebサービスURL	-
ユーザ登録	無し