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このデータベースについて

連鎖順序情報

データ説明
データ名
連鎖順序情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00318-02-005
データ内容の説明
連鎖地図を作製した時のフレームとなる1174個のマーカーについて染色体ごとに、マーカー名、次のマーカーとの距離、遺伝型が決定できた個体数及びマーカーの遺伝形式のリストです。
データファイル
データファイル名 :
rgp_gmap98_linkage_order.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
8.7 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/rgp_gmap98_linkage_order
データ取得方法

-

解析方法

windowサイズ「5」、LOD閾値「2.0」で「ripple」コマンドを実行し、染色体全体での異なる位置にあるマーカーの最適な並び順を調べました。

データ件数

1,174 件

データ詳細
項目名 項目の説明
Chrom. No.

染色体番号

Order

連鎖順序

Markers

マーカー名

Distance

順序が1つ後ろのマーカーまでの遺伝的距離(cM)

Genotypes

mapping populationにおけるマーカーごとに観測された遺伝子型の数 codom:共優性マーカー +/-:優性マーカー