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RGP gmap2000
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
RGP gmap2000
名称の読み方
-
別名
RGP: The Latest High-Density Rice Genetic Map, Including 3267 Markers
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00318-03-000
作成者
作成氏名
春島嘉章
作成者英名
Yoshiaki Harushima
作成者所属
社団法人農林水産先端技術研究所
作成氏名
倉田のり
作成者英名
Nori Kurata
作成者所属
農業生物資源研究所
作成氏名
長村吉晃
作成者英名
Yoshiaki Nagamura
作成者所属
社団法人農林水産先端技術研究所
作成氏名
矢野昌裕
作成者英名
Masahiro Yano
作成者所属
農業生物資源研究所
作成氏名
佐々木卓治*
作成者英名
Takuji Sasaki
作成者所属
農業生物資源研究所
連絡先
〒305-8602 茨城県つくば市観音台2-1-2
国立研究開発法人 農業生物資源研究所
松本隆
E-mail : rgp_gmap2000_address
片寄裕一
E-mail : rgp_gmap2000_address2
データベース分類

植物データベース-イネ

データベース分類

ゲノム
配列

生物種
Taxonomy Name
Oryza sativa
Taxonomy ID
データベースの説明

このデータベースでは、1998年の高密度RFLP連鎖地図公開以降に生成された1000近いRFLPマーカーを含む、3267個のRFLPマーカー情報で構成される連鎖地図(2000年版)を提供します。

データベースの特長・有用性・活用方法

連鎖地図データは12の染色体毎に表で表示され、各染色体毎に短腕のテロメア末端からの地図上の位置(遺伝的距離をcMで表示)、マーカー名、RFLP分析でプローブとして使用した挿入断片である5'末端と3'末端配列のDDBJ accession番号(入手可能な場合のみ)が含まれます。
このアーカイブは下記の最終更新日のデータを元に作成されており、現状とは必ずしも一致しない場合があります。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
第2期イネゲノム解析研究プロジェクト(平成10~16年)
論文等
-
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所
オリジナルサイト
(公開停止中)http://rgp.dna.affrc.go.jp/E/publicdata/geneticmap2000/index.html
運用開始年月日
2000/11/30
最終更新年月日
2000/11/30
統括サイト
http://rgp.dna.affrc.go.jp/
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース

MAFF_Rice cDNA Clone
DDBJ

一覧表示
有り
クエリ検索
無し
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し