データベースの説明

データベース全般
名称	PCDq
名称の読み方	ピー・シー・ディー・キュー
別名	Protein Complex Database with complex quality index
DOI	10.18908/lsdba.nbdc01200-000
作成者	作成氏名喜久川　真悟作成者英名 Shingo Kikugawa 作成者所属（独）産業技術総合研究所作成氏名西潟憲策作成者英名 Kensaku Nishikata 作成者所属 NECソフト株式会社作成氏名村上勝彦作成者英名 Katsuhiko Murakami 作成者所属（独）産業技術総合研究所作成氏名佐藤慶治作成者英名 Yoshiharu Sato 作成者所属（独）産業技術総合研究所作成氏名鈴木満美作成者英名 Mami Suzuki 作成者所属（独）産業技術総合研究所作成氏名モハメッド　アルタフル　アミン作成者英名 Md. Altaf-Ul-Amin 作成者所属奈良先端科学技術大学院大学作成氏名金谷　重彦作成者英名 Shigehiko Kanaya 作成者所属奈良先端科学技術大学院大学作成氏名今西規* 作成者英名 Tadashi Imanishi 作成者所属（独）産業技術総合研究所
連絡先	（独）産業技術総合研究所創薬分子プロファイリング研究センター今西規（Imanishi Tadashi） Email: Tel:（代表）03-3599-8800
データベース分類	タンパク質複合体データベース
生物種	Taxonomy Name Homo sapiens Taxonomy ID 9606
データベースの説明	PCDq は、予測複合体を含めたヒト蛋白質複合体のデータベースです。
データベースの特長・有用性・活用方法	BIND、DIP、MINT、HPRD、IntActおよびGNP_Y2Hの６つの蛋白質間相互作用（PPI）データを整理統合し、PPIネットワークの密な領域から蛋白質複合体が予測され、それらを文献と比較し修正することで、既知の複合体情報と予測された複合体情報の両方を格納しています。既知と予測のサブユニットを区別・活用するため、品質管理指数（complex quality index: CQI）を、各複合体に付与しています。また、複雑なネットワークを簡素に示す図を表示・編集できる機能PPI-Mapがあります。＊慣行に従い、PCDqを研究等で利用する場合は、「論文等」に記載されている論文を引用してください。
データベースの利用許諾	CC 表示-継承詳細
予算的背景・プロジェクト	名称 <a href="http://medals.jp/project_list/detail/3.html" target="_blank">ゲノム情報統合プロジェクト</a> (2005-2007年)
論文等	文献名 PCDq: human protein complex database with quality index which summarizes different levels of evidences of protein complexes predicted from h-invitational protein-protein interactions integrative dataset. 著者名 Kikugawa S, Nishikata K, Murakami K, Sato Y, Suzuki M, Altaf-Ul-Amin M, Kanaya S, Imanishi T. 雑誌名/掲載年月/号 BMC Syst Biol. 2012 Dec 12; 6 Suppl 2:S7 外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所	産業技術総合研究所　創薬分子プロファイリング研究センター
オリジナルサイト	http://h-invitational.jp/hinv/pcdq/
運用開始年月日	2012/08/03
最終更新年月日	2012/07/23
統括サイト	http://h-invitational.jp/hinv/ahg-db/index_ja.jsp
データの一括ダウンロードサイト	http://h-invitational.jp/hinv/dataset/download.cgi
参照先データベース	HIP \| HIT \| HIX \| UniProt \| RefSeq \| GeneID \| CCDS \| BIND \| DIP \| MINT \| HPRD \| IntAct \| GNP_Y2H \| PubMed
一覧表示	有り
クエリ検索	有り
Webサービス	無し
WebサービスURL	-
ユーザ登録	無し