データ説明 | ||||||||||||||||||
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トラップされた遺伝子に関する情報 | |||||||||||||||||
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ES細胞クローンでトラップされた遺伝子の情報と、回収されたcDNA断片の塩基配列。 | |||||||||||||||||
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http://togodb.biosciencedbc.jp/naistrap_db | |||||||||||||||||
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poly-A trap 型ベクターによってランダムに遺伝子をトラップし、 その cDNA 断片を 3’ RACE 法(特殊な PCR 技術)を用いて増幅して塩基配列を得ている | |||||||||||||||||
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3' RACE により得られた塩基配列を用いて BLAST検索等を実施し、トラップした遺伝子を特定している。 | |||||||||||||||||
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585件 | |||||||||||||||||
データ詳細 | ||||||||||||||||||
データ中の各注釈の意味は下記になります。
(*) Ambiguity remains about the 5' border of the deleted region.
(**) "Unknown genes" stand for the DNA segments whose nucleotide sequences were
either (1) found only in the genomic DNA contigs without any functional
annotations or (2) not found anywhere in the current NCBI genome databases.
(***) The reverse (i.e., antisense) strand of a known gene was trapped.
(****) The trapped segment contained repetitive DNA sequences.
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