データベースの説明

ヒト遺伝子/疾患

Legenda は文献から抽出した疾患-遺伝子-物質との関係を納めた疾患情報テキストマイニングデータベースです。PubMed 全体の文献のアブストラクトを用いて、遺伝子名、疾患名、などを識別し、用語の共起関係に基づく遺伝子と疾患の関係についての網羅的な解析を行いました。

Legendaではコンセプトのペアが持つ関連度を、2種の指標（MIMとMMIM）で計算し、DBに格納しています。MIM（Mutual Information Measure）は、２つの確率変数の直接的な相互依存の尺度を表す為に利用しています。また、MMIMは、間接的な依存の尺度を表しています。更に、独自の3種（遺伝子辞書、遺伝子機能辞書、疾患・物質名辞書）の辞書を格納しています。