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このデータベースについて

Blocks search result

データ説明
データ名
Blocks search result
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00120-022
データ内容の説明
Blocksモチーフデータベースの検索結果
データファイル
データファイル名 :
kome_blocks_search_result.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
60 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_blocks_search_result
データ取得方法

データベースとしてBlocks Database Version 14.0 (October 2003)を使用。

解析方法

既知のモチーフデータベースであるBlocksに検索をかけた。
データベースとしてBlocks Database Version 14.0 (October 2003)を、検索プログラムはBLIMPS Version 3.6を用いた。

データ件数

1,603,600 件

データ詳細
項目名 項目の説明
 ACCESSION_NO

 完全長cDNAクローンのアクセッション番号

 CLONE_NAME

 完全長cDNAクローンの名称

 RANK

 blocks検索結果の順位

 ACCESSION

 blocksモチーフのアクセッション番号

 DESCRIPTION

 blocksモチーフの説明

 STRENGTH

 blimps検索の強度

 SCORE

 blimps検索のスコア

 RF

 Reading Frame (アミノ酸配列のため常に0)

 POSITION

 モチーフの位置

 MOTIF_SEQ

 blocksモチーフのアミノ酸配列

 MOTIF_LENGTH

 blocksモチーフのアミノ酸の長さ