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生命科学系データベースアーカイブ

KOME

Blocks search result

データ説明

info データ名 Blocks search result
info DOI 
info データ内容の説明 

Blocksモチーフデータベースの検索結果

info データファイル 
データファイル名:
kome_blocks_search_result.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/kome/LATEST/kome_blocks_search_result.zip
ファイルサイズ:
60 MB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

データベースとしてBlocks Database Version 14.0 (October 2003)を使用。

info 解析方法 

既知のモチーフデータベースであるBlocksに検索をかけた。
データベースとしてBlocks Database Version 14.0 (October 2003)を、検索プログラムはBLIMPS Version 3.6を用いた。

info データ件数 

1,603,600 件

データ詳細

項目名項目の説明
 ACCESSION_NO  完全長cDNAクローンのアクセッション番号
 CLONE_NAME  完全長cDNAクローンの名称
 RANK  blocks検索結果の順位
 ACCESSION  blocksモチーフのアクセッション番号
 DESCRIPTION  blocksモチーフの説明
 STRENGTH  blimps検索の強度
 SCORE  blimps検索のスコア
 RF  Reading Frame （アミノ酸配列のため常に0）
 POSITION  モチーフの位置
 MOTIF_SEQ  blocksモチーフのアミノ酸配列
 MOTIF_LENGTH  blocksモチーフのアミノ酸の長さ