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このデータベースについて

PIR search result

データ説明
データ名
PIR search result
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00120-018
データ内容の説明
PIRプロテインデータベースでblastx検索した結果
データファイル
データファイル名 :
kome_pir_search_result.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
29 MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/kome_pir_search_result
データ取得方法

データベースはPIR Release 80.00 (December 31, 2004)を使用。

解析方法

PIRプロテインデータベースに対して、Blastxを行った。
閾値は1e-10とし、最も相同性が高かったものを表示している。

データ件数

1,549,409 件

データ詳細
項目名 項目の説明
 ACCESSION_NO

 完全長cDNAクローンのアクセッション番号

 CLONE_NAME

 完全長cDNAクローンの名称

 RANK

 blast検索結果の順位

 PIR_ACCESSION

 PIRタンパク質データベースでのアクセッション番号

 DEFINITION

 PIRタンパク質の定義

 EXPECT

 blastx検索の期待値

 SCORE

 blastx検索のスコア