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GRIPDB
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
GRIPDB
名称の読み方
グリップデータベース
別名
GPCRs Interaction Partners Database
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01665-000
作成者
作成氏名
根本 航*
作成者英名
Wataru Nemoto
作成者所属
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
作成者の文献検索
作成氏名
福井 一彦
作成者英名
Kazuhiko Fukui
作成者所属
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
作成者の文献検索
作成氏名
藤 博幸
作成者英名
Hiroyuki Toh
作成者所属
産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター
作成者の文献検索
連絡先
根本 航
gripdb address
データベース分類

タンパク質配列データベース-タンパク質配列モチーフ、タンパク質活性部位
タンパク質配列データベース-タンパク質ファミリー別データベース
構造データベース-タンパク質構造

生物種
Taxonomy Name
Homo Sapiens
Taxonomy ID
データベースの説明

Gタンパク質共役型受容体同士の相互作用ペアについての情報を提供するデータベースです。実験または予測により確認された相互作用領域の情報が格納されています。ペアを構成するモノマーの立体構造上での相互作用インターフェイスの位置情報も、実験もしくは予測により提供されています。

データベースの特長・有用性・活用方法

相互作用のためのインターフェイスへの変異導入は、相互作用ペアの機能解析のための指針となります。インターフェイスを模倣したペプチドもしくは低分子の設計は、機能制御に利用できます。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
戦略的国際科学技術協力推進事業 日本-インド研究交流研究課題「グリッドコンピューティング環境による生体高分子複合体の認識メカニズム研究」(科学技術振興機構)
論文等
文献名
GRIPDB - G protein coupled Receptor Interaction Partners DataBase.
著者名
Nemoto W, Fukui K, Toh H.
雑誌名/掲載年月/号
J Recept Signal Transduct Res. 2011 Jun;31(3):199-205.
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所

産業技術総合研究所 臨海副都心センター
※オリジナルサイトでの公開を終了

オリジナルサイト
(運用終了) http://grip.cbrc.jp/GDB/index.html
運用開始年月日
2009/1/30
最終更新年月日
-
統括サイト
-
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース

PDB, RefSeq, PubMed

一覧表示
有り
クエリ検索
有り
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
有り