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GETDB
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
GETDB
名称の読み方
ゲットディービー
別名
Gal4 Enhancer Trap Insertion Database
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00236-000
作成者
作成氏名
林 茂生*
作成者英名
Shigeo Hayashi
作成者所属
理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター
連絡先

〒650-0047
兵庫県神戸市中央区港島南町2-2-3
発生再生科学総合研究センター
形態形成シグナル研究グループ
Tel: 078-306-3185 / FAX: 078-306-3183
E-mail:

データベース分類

ゲノムデータベース(無脊椎動物)-無脊椎動物ゲノムデータベース

生物種
Taxonomy Name
Drosophila melanogaster
Taxonomy ID
データベースの説明

ショウジョウバエにおいてGal4-UAS法に基づくエンハンサートラップ系統をNPコンソーシアムとして約4600の挿入系統を作成し、 それらのすべてについてエンハンサー活性を胚および幼虫において検定した。 また挿入位置をゲノム配列上にマップして遺伝子との対応関係を2157カ所の独立したサイトについて明らかにした。 本データベースはGal4エンハンサートラップ系統の挿入位置とエンハンサー活性のパターンをまとめたデータベースとして公開されている。

データベースの特長・有用性・活用方法

系統については国立遺伝学研究所と京都工芸繊維大学ショウジョウバエ遺伝資源センターにおいて維持、配布されている。

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
文部科学省 ゲノム特定研究(2000~2004年度)
名称
日本学術振興会 未来開拓学術研究推進事業
論文等
文献名
GETDB, a database compiling expression patterns and molecular locations of a collection of Gal4 enhancer traps.
著者名
Hayashi S, Ito K, Sado Y, Taniguchi M, Akimoto A, Takeuchi H, Aigaki T, Matsuzaki F, Nakagoshi H, Tanimura T, Ueda R, Uemura T, Yoshihara M, Goto S.
雑誌名/掲載年月/号
Genesis. 2002 Sep-Oct;34(1-2):58-61.
外部リンク
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所
オリジナルサイト
http://kyotofly.kit.jp/stocks/GETDB/getdb.html
運用開始年月日
2003/8/1
最終更新年月日
2009/9/4
統括サイト
http://fruitfly.jp/
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース
一覧表示
有り
クエリ検索
有り
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し