GDBS
このデータベースについて
データベースの説明
| データベース全般 | |
名称
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GDBS
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名称の読み方
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ジーデービーエス |
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別名
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Gene Diversity DataBase System |
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc00070-000 |
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作成者
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作成氏名
五條堀 孝*
作成者英名
Takashi Gojobori
作成者所属
国立遺伝学研究所
作成氏名
猪子 英俊
作成者英名
Hidetoshi Inoko
作成者所属
東海大学 医学部
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連絡先
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（独）産業技術総合研究所 |
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データベース分類
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ヒト遺伝子/疾患-多型データベース全般 |
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生物種
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データベースの説明
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NEDO遺伝子多様性モデル解析事業(http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/show/lsdb_project/19)において実施された、自己免疫疾患（関節リウマチ、尋常性乾癬）及び摂食障害に関連するSNPsを同定するためのタイピングデータ。実験の進行順に以下の３種類のタイピングデータが公開されている。
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データベースの特長・有用性・活用方法
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モデル疾患として選択した多因子性疾患について収集した遺伝子多型情報（JBIRCで収集し実験で多型性を確認したマイクロサテライト等）の2つのデータ ベースと疾患関連遺伝子を同定する実験・解析フロー（各種の検定、連鎖不平衡係数推定、集団のハプロタイプ頻度推定、ハプロタイプ組合せ分布推定等）のた めの7つの解析ツールである。Web上の解析サービスは平成19年3月で終了しました。解析ソフトウェアダウンロードサービスは利用可能である。 |
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データベースの利用許諾
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CC 表示-継承 詳細 |
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予算的背景・プロジェクト
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名称
NEDO遺伝子多様性モデル解析事業  |
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論文等
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文献名
Whole genome association study of rheumatoid arthritis using 27,039 microsatellites.
著者名
Tamiya G, Shinya M, Imanishi T, Ikuta T, Makino S, Okamoto K, Furugaki K, Matsumoto T, Mano S, Ando S, Nozaki Y, Yukawa W, Nakashige R, Yamaguchi D, Ishibashi H, Yonekura M, Nakami Y, Takayama S, Endo T, Saruwatari T, Yagura M, Yoshikawa Y, Fujimoto K, Oka A, Chiku S, Linsen SEV, Giphart MJ, Kulski JK, Fukazawa T, Hashimoto H, M Kimura, Hoshina Y, Suzuki Y, Hotta T, Mochida J, Minezaki T, Komai K, Shiozawa S, Taniguchi A, Yamanaka H, Kamatani N, Gojobori T, Bahram S, Inoko H.
雑誌名/掲載年月/号
Hum Mol Genetics 14: 2305-2321, 2005.
外部リンク
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| データベースのオリジナルサイト情報 | |
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データベース運用場所
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産業技術総合研究所 バイオメディシナル情報研究センター |
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オリジナルサイト
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運用終了 |
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運用開始年月日
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2005 |
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最終更新年月日
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2007 |
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統括サイト
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http://www.h-invitational.jp |
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データの一括ダウンロードサイト
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参照先データベース
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一覧表示
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有り |
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クエリ検索
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有り |
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Webサービス
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無し |
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WebサービスURL
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ユーザ登録
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無し |
