データベース全般 | ||||||||||||||||||
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Fluorome | |||||||||||||||||
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フルオローム | |||||||||||||||||
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The Cyanobacterial Chlorophyll Fluorescence Database | |||||||||||||||||
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〒162-8480 東京都新宿区若松町2-2 早稲田大学 教育・総合科学学術院 電話：03-5369-7306 メール：  |
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原核光合成生物であるシアノバクテリアのクロロフィル蛍光強度の時間変化を変異株ごとに取得したデータベースです。 各遺伝子破壊株のクロロフィル蛍光挙動をグラフィックに見ることができると共に、その蛍光挙動が２つの遺伝子破壊株の間でどの程度異なるかを定量化し、 自分が注目する遺伝子破壊株とよく似た蛍光挙動を示す遺伝子破壊株をリストアップすることができます。 遺伝子の機能を明らかにするためには、遺伝子変異株の表現型の解析が行なわれます。 しかし、遺伝子の機能によって異なる解析手法を使う必要があり、ゲノム単位で大規模な解析を行なうことも困難です。 さらに言えば、そもそも、何の表現型を解析すればよいのか、ということがわからなければ、解析の進めようさえありません。 この状況を打破するために、本プロジェクトではゲノム特定研究の支援を受け、光合成生物のクロロフィル蛍光をプローブとして用い、蛍光という単一の表現型 を使いながら、 ゲノム上の全遺伝子の半分程度について、遺伝子破壊株の表現型を得るシステムを構築しました。 |
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マイクロアレイなどを用いた共発現解析などと同様に、自分が興味を持っている遺伝子と何らかの関連がある可能性がある遺伝子を特定の前提条件なしにリストアップすることができます。 | |||||||||||||||||
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文部科学省特定領域研究 ゲノム研究 https://www.genome-sci.jp/tokutei2005/modules/g4_paper2/paperinfo.php?paperid=5007 |
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データベースのオリジナルサイト情報 | ||||||||||||||||||
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早稲田大学 教育学部理学科 | |||||||||||||||||
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2007/6/23 | |||||||||||||||||
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2011/10/28 | |||||||||||||||||
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CyanoBase | |||||||||||||||||
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無し | |||||||||||||||||
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有り | |||||||||||||||||
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無し | |||||||||||||||||
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無し | |||||||||||||||||
