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DNA ProbeLocator
このデータベースについて

データベースの説明

データベース全般
名称
DNA ProbeLocator
名称の読み方
ディーエヌエプローブロケーター
別名
マイクロアレイプローブデータベース
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01077-000
作成者
作成氏名
日紫喜光良*
作成者英名
Teruyoshi Hishiki
作成者所属
東邦大学
連絡先

(独)産業技術総合研究所
創薬分子プロファイリング研究センター
今西 規(Imanishi Tadashi)
Email: gdbs_address
Tel:(代表)03-3599-8800

データベース分類

マイクロアレイデータ、その他の発現データのデータベース

生物種
Taxonomy Name
Homo sapiens
Taxonomy ID
データベースの説明

アフィメトリクス、アジレント、ならびにDNAチップ研究所から提供された多様なプラットフォームのマイクロアレイプローブ配列すべてを完全長cDNA配列に対してマッピングした結果を格納しています。

データベースの特長・有用性・活用方法

DNA ProbeLocatorはプローブのマッピングデータをエクソン構造と共に、直感的に表現するデータベースです。データはヒトゲノム(build35)を用いており、H-InvDBに格納されている完全長のクローンで検証された遺伝子に関するアノテーション情報を提供します。
現在、下記のプラットフォームのデータが格納されています。
 


  1. Affymetrix GeneChip (HG-Focus, HG-U133A, HG-U133A_2, HG-U133B, HG-U133_Plus_2, HG-U95A,HG-U95Av2, HG-U95B, HG-U95C, HG-U95D, HG-U95E, HuGene FL, HuEx-1_0)

  2. DNA Chip Research Inc. AceGene Human Oligo Chip 30K

  3. I.M.A.G.E. (1673145 clones)

  4. Agilent-012097 Human 1A Oligo Microarray (V2) (G4110B)

  5. Agilent-012391 Whole Human Genome Oligo Microarray (G4112A)


 

データベースの利用許諾
CC 表示-継承 詳細
予算的背景・プロジェクト
名称
ゲノム情報統合プロジェクト (経済産業省 2005~2007)
論文等
-
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所

(独)産業技術総合研究所
※オリジナルサイトでの公開を終了

オリジナルサイト
-
運用開始年月日
2007
最終更新年月日
2009
統括サイト
-
データの一括ダウンロードサイト
-
参照先データベース
-
一覧表示
有り
クエリ検索
有り
Webサービス
無し
WebサービスURL
-
ユーザ登録
無し