このデータベースについて
Refgene_exonデータ
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データ名
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Refgene_exonデータ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc01077-007 |
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データ内容の説明
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H-Invitational transcript ID (HIT) に関するアノテーション情報 ただし、chrが「_random」を含むエントリは、各座標に関して注意が必要である。 UCSCの「_random」を含むゲノム配列の構成は、染色体中の位置が未確定のセグメントを 50,000bpのスペーサーで挟んで１本に繋いだものとなっている （ http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQdownloads.html#download9, http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQdownloads.html#download10 ）。 このゲノム配列にHIT転写物がマッピングされているので、以下の座標表記となっている。 a_*：各セグメント上の座標を示す。セグメントの区別は記載なし。 cds_*、e_*：セグメントを50,000bpのスペーサーを挟みつつ１本に繋いだ上での座標。 なお同一転写物のexonが異なるセグメントにマッピングされているケースもある。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データファイル
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データファイル名 :
dnaprobelocator_refgene_exon.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
19.1MB
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簡易検索URL
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http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dnaprobelocator_refgene_exon | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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データ取得方法
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H-Invitational DBから取得 |
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解析方法
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- |
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データ件数
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167,564件 |
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| データ詳細 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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