- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に!-
このデータベースについて

Locuslinkデータ

データ説明
データ名
Locuslinkデータ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01077-006
データ内容の説明
遺伝子座に関するアノテーション情報 ただし、chrが「_random」を含むエントリは、各座標に関して注意が必要である。 UCSCの「_random」を含むゲノム配列の構成は、染色体中の位置が未確定のセグメントを 50,000bpのスペーサーで挟んで1本に繋いだものとなっている ( http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQdownloads.html#download9, http://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQdownloads.html#download10 )。 このゲノム配列にHIT転写物がマッピングされているので、以下の座標表記となっている。 h_*:各セグメント上の座標を示す。セグメントの区別は記載なし。 なお同一転写物のexonが異なるセグメントにマッピングされているケースもある。
データファイル
データファイル名 :
dnaprobelocator_locuslink.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
2.5MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dnaprobelocator_locuslink
データ取得方法

H-Invitational DBから取得

解析方法

-

データ件数

35,005件

データ詳細
項目名 項目の説明
 hosac

 H-Invitational cluster ID (HIX)

 chr

 染色体番号

 h_start

 遺伝子座開始座標

 h_end

 遺伝子座終了座標

 strand

 ストランド

 ext

 H-Invitational transcript ID (HIT)

 acc

 Genbank accession number

 unigene

 Unigene entry name

 locus

 Locus ID

 omim

 Omim ID

 definition

 Definition