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このデータベースについて

I・M・A・G・Eデータ

データ説明
データ名
I・M・A・G・Eデータ
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01077-005
データ内容の説明
I.M.A.G.E コンソーシアムの cDNA 配列について、H-InvDB のユニークな転写物にマップした結果のリスト
データファイル
データファイル名 :
dnaprobelocator_image.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
689MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dnaprobelocator_image
データ取得方法

I.M.A.G.E. Consortiumより取得

解析方法

遺伝子・転写物との対応関係をマッピング処理にて取得

データ件数

1,673,144件

データ詳細
項目名 項目の説明
 probe_set

 プローブセット名

 acc

 ESTのGenBank Accession ID

 lst

 (full length cDNAのNCBI GenBank accession):(blastにおける対応開始位置)(type(+/-))(対応する配列の長さ):(4桁=score)(2桁=percentage)(probability)*scoreは整数 または(整数部小数部併せて4桁の)小数*percentageは00のとき100の意味*probabilityは ・Zの場合、0 ・_(整数)の場合、e-(整数) ・(整数)、つまり「_」なしの場合、(1桁)e-(残りの桁)