データベースの説明

データベース全般
名称	DMPD
名称の読み方	ディーエムピーディー
別名	Dynamic Macrophage Pathway CSML Database
DOI	10.18908/lsdba.nbdc00558-000
作成者	作成氏名長崎正朗作成者英名 Masao Nagasaki 作成者所属東京大学医科学研究所作成氏名斉藤あゆむ作成者英名 Ayumu Saito 作成者所属東京大学医科学研究所作成氏名藤田アンドレ作成者英名 Andre Fujita 作成者所属東京大学医科学研究所作成氏名植野和子作成者英名 Kazuko Ueno 作成者所属東京大学医科学研究所作成氏名池田恵美作成者英名 Emi Ikeda 作成者所属東京大学医科学研究所作成氏名鄭恩娥作成者英名 Euna Jeong 作成者所属東京大学医科学研究所作成氏名宮野悟* 作成者英名 Satoru Miyano 作成者所属東京大学医科学研究所作成氏名日本バイオベース株式会社作成者英名作成者所属
連絡先	〒108-8639 東京都港区白金台４－６－１東京大学医科学研究所ヒトゲノム解析センター DNA情報解析分野 TEL: 03-5449-5615 FAX: 03-5449-5442 E-mail:
データベース分類	代謝系/シグナル伝達系パスウェイ
生物種	Taxonomy Name Homo sapiens Taxonomy ID 9606 Taxonomy Name Mammalia Taxonomy ID 40674
データベースの説明	マクロファージに対する LPS 及び PMA 刺激に関連する文献キュレーションを行い、動的なシミュレーションができる CSML 形式の転写制御・シグナル伝達パスウェイモデルを集積したデータベース
データベースの特長・有用性・活用方法	【特徴】マクロファージの分化、活性化に関しての200あまりの重要な文献から、同制御にかかわるパスウェイをXML形式の１つCSMLフォーマットで抽出した、世界最大のパスウェイシミュレーションモデルデータベースです。【有用性・活用方法】 CSML形式は、システムバイオロジーのソフトウェアの１つ、セルイラストレータで編集、シミュレーションが可能です。マクロファージ関連の研究をおこなっている研究者は、関連するモデルを検索してさらにそのパスウェイをカスタマイズして利用することが可能です。また、１つのパスウェイの一部を取り出して利用したり、複数のパスウェイを編集・統合してより大きなパスウェイモデルとして利用することもできます。また、各モデルはPNGなどの画像でも公開しているため一般的なブラウザでもパスウェイの概要を把握することができます。
データベースの利用許諾	CC 表示-継承詳細
予算的背景・プロジェクト	名称文部科学省ゲノムネットワークプロジェクト (GNP) での研究成果
論文等	-
データベースのオリジナルサイト情報
データベース運用場所	東京大学医科学研究所
オリジナルサイト	http://gnp.hgc.jp/macrophage/
運用開始年月日	2009/3
最終更新年月日	2009/8
統括サイト	http://gnp.hgc.jp/
データの一括ダウンロードサイト	http://gnp.hgc.jp/macrophage/
参照先データベース	PubMed
一覧表示	無し
クエリ検索	有り
Webサービス	無し
WebサービスURL	-
ユーザ登録	無し