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このデータベースについて

遺伝子破壊株セットを用いた網羅的表現型解析 - 乾燥ストレス

データ説明
データ名
遺伝子破壊株セットを用いた網羅的表現型解析 - 乾燥ストレス
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00953-007
データ内容の説明
パン酵母は、ドライイースト製造の過程で過酷な乾燥ストレスに曝されます。我々は、乾燥ストレス耐性に必要な遺伝子を明らかにすることを目的に、出芽酵母の非必須遺伝子の破壊株セットを用いたゲノムワイドなスクリーニングを行いました。その結果、乾燥ストレス感受性を示す278株の遺伝子破壊株を同定することが出来ました。感受性株の破壊遺伝子の中には、液胞酸性化を担う液胞型プロトンATPaseやミトコンドリア機能に関与するものが多く含まれていました。これらの機能は、乾燥ストレスによって液胞酸性化欠損株の細胞内pHが顕著に低下すること、および乾燥ストレスによってミトコンドリア膜電位が喪失することから、乾燥ストレス耐性において重要な役割を担っている可能性が示唆されました。乾燥ストレス感受性と酸化ストレス感受性との関連について調べたところ、酸化ストレスは乾燥ストレスに対する感受性を決定付ける重要な要素であるにも関わらず、酸化ストレス耐性への関与が知られている活性酸素種消去システムは、乾燥ストレス耐性には必須ではない可能性が示唆されました。
データファイル
データファイル名 :
CSV形式: dgby_air_drying_stress.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
89KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dgby_air_drying_stress
データ取得方法

YPD培地で30℃で25時間(非ストレスの対照では16時間)培養した後の630nmのODをマイクロタイタープレートリーダー(Elx800)で測定

解析方法

変異株と野生型BY4743のOD比を計算

データ件数

4,713件

データ詳細
項目名 項目の説明
ORF

ORF名、SGD(Saccharomyces Genome Database;http://www.yeastgenome.org/) におけるSystematic Name

GENE

遺伝子名、SGDにおけるStandard Name

Growth rate BM/BW

非ストレス条件の増殖速度(変異型/野生型の比)

Growth rate (DM/DW)/(BM/BW)

乾燥ストレス後の増殖速度(変異型/野生型の比)のストレス無しでの増殖速度(変異型/野生型の比)に対する比

DESCRIPTION (MIPS)

MIPS(Munich Information Center for Protein Sequences)における遺伝子の説明