このデータベースについて
データディレクトリ
| データ説明 | |||
データ名
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データディレクトリ | ||
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DOI
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10.18908/lsdba.nbdc01558-006.V020 |
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データ内容の説明
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ChIP-Atlas において既報のChIP-Seq データを再解析し得られたデータをリファレンスゲノムデータごとに整理されたディレクトリ内で公開している。各Experiment ごとのデータはBigWig ファイル、Bed ファイル, BigBed ファイルを用意している。抗体と細胞種ごとに結合されたデータはBed ファイルを用意している。また、Target genes analysis およびColocalization analysis で用いたデータも公開している。詳細は <a href="https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki#peak_browser_doc" target="_blank">https://github.com/inutano/chip-atlas/wiki#peak_browser_doc</a> を参照のこと。 <span style="color: #ff0000;">※過去バージョンのデータはダウンロードできません。</span> | ||
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データファイル
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データファイル名 :
hg19
データのURL :
ファイルサイズ :
30 TB
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簡易検索URL
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データ取得方法
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Sequence Read Archive からダウンロードしたデータを標準的なデータ解析パイプラインによって処理した。詳細はhttps://github.com/inutano/chip-atlas/wiki を参照のこと。 |
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解析方法
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データ件数
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5,805,470 ファイル |
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| データ詳細 | |||
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