データベース全般 | ||||||||||||||||||||
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AcEST | |||||||||||||||||||
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アセスト | |||||||||||||||||||
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Adiantum capillus-veneris EST | |||||||||||||||||||
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〒192-0397 東京都八王子市南大沢1-1 首都大学東京 大学院理工学研究科生命科学専攻 植物環境応答研究室 Tel: 042-677-1111(ext.3654) E-mail:  |
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首都大学東京で決定したホウライシダのESTシーケンスと、それらのシーケンスとUniProtKB/Swiss-Prot、TrEMBLデータベースと の間で行ったblastx検索の結果をデータベース化したものである。これまで、様々な植物ゲノム解析が進められているが、陸上植物(種子、シダ、コケ植物)の中でシダ植物のゲノムに関する研究は発展していない。そこで光形態形成に関する研究に用いられてきたホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)をシダのモデル植物として位置づけるために、 EST配列の解析を行った。 | |||||||||||||||||||
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AcESTはホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)のEST配列データ約3万件に二次情報を追加したデータベースである。シダ植物の新規遺伝子を探索するために活用することが可能であり、遺伝子の進化の解明やシダ植物特異的な遺伝子情報の収集をすることが出来る。 | |||||||||||||||||||
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首都大学東京の基本研究費による研究 | |||||||||||||||||||
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データベースのオリジナルサイト情報 | ||||||||||||||||||||
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首都大学東京 大学院理工学研究科生命科学専攻 植物環境応答研究室 | |||||||||||||||||||
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2009/6/12 | |||||||||||||||||||
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2009/11 | |||||||||||||||||||
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http://togodb.dbcls.jp/acest/ | |||||||||||||||||||
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有り | |||||||||||||||||||
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有り | |||||||||||||||||||
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無し | |||||||||||||||||||
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無し | |||||||||||||||||||
