AcEST
このデータベースについて
データベースの説明
| データベース全般 | |
名称
|
AcEST
 |
|---|---|
|
名称の読み方
|
アセスト |
|
別名
|
Adiantum capillus-veneris EST |
|
DOI
|
10.18908/lsdba.nbdc00839-000 |
|
作成者
|
作成氏名
鐘ヶ江 弘美
作成者英名
Hiromi Kanegae
作成者所属
首都大学東京
作成氏名
癸生川 絵里
作成者英名
Eri Kibukawa
作成者所属
サイエンス・テクノロジー・システムズ株式会社
作成氏名
鐘ヶ江 健*
作成者英名
Takeshi Kanegae
作成者所属
首都大学東京
|
|
連絡先
|
〒192-0397 |
|
データベース分類
|
塩基配列データベース
|
|
生物種
|
|
|
データベースの説明
|
首都大学東京で決定したホウライシダのESTシーケンスと、それらのシーケンスとUniProtKB/Swiss-Prot、TrEMBLデータベースと の間で行ったblastx検索の結果をデータベース化したものである。これまで、様々な植物ゲノム解析が進められているが、陸上植物(種子、シダ、コケ植物)の中でシダ植物のゲノムに関する研究は発展していない。そこで光形態形成に関する研究に用いられてきたホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)をシダのモデル植物として位置づけるために、 EST配列の解析を行った。 |
|
データベースの特長・有用性・活用方法
|
AcESTはホウライシダ(Adiantum capillus-veneris)のEST配列データ約3万件に二次情報を追加したデータベースである。シダ植物の新規遺伝子を探索するために活用することが可能であり、遺伝子の進化の解明やシダ植物特異的な遺伝子情報の収集をすることが出来る。 |
|
データベースの利用許諾
|
CC 表示-継承 詳細 |
|
予算的背景・プロジェクト
|
名称
首都大学東京の基本研究費による研究
|
|
論文等
|
文献名
Analysis of expressed sequence tags in prothallia of Adiantum capillus-veneris.
著者名
Yamauchi, D., Sutoh, K., Kanegae, H., Horiguchi, T., Matsuoka, K., Fukuda, H., Wada, M.
雑誌名/掲載年月/号
J. Plant Res. 118 (3): 223-227.
外部リンク
  |
| データベースのオリジナルサイト情報 | |
|
データベース運用場所
|
|
|
オリジナルサイト
|
http://togodb.dbcls.jp/acest/ |
|
運用開始年月日
|
2009/6/12 |
|
最終更新年月日
|
2009/11 |
|
統括サイト
|
- |
|
データの一括ダウンロードサイト
|
http://togodb.dbcls.jp/acest/ |
|
参照先データベース
|
- |
|
一覧表示
|
有り |
|
クエリ検索
|
有り |
|
Webサービス
|
無し |
|
WebサービスURL
|
- |
|
ユーザ登録
|
無し |
