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このデータベースについて

BlastX Result : TrEMBL

データ説明
データ名
BlastX Result : TrEMBL
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00839-003
データ内容の説明
ホウライシダ EST(AcEST, Adiantum capillus-veneris EST)配列と、UniProtKB/TrEMBL(release 39.9) データベースとの間でblastx検索を実行した結果。Blastxヒットリストのうち、各ヒットのアラインメント情報を一つの行に記載。 CSV 形式テキストファイル。
データファイル
データファイル名 :
blasthits_tr.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
7.03MB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/archive_acest_blasthits_tr
データ取得方法

blastx検索

解析方法

ホウライシダEST配列と、UniProtKB/TrEMBL データベースとの間でblastx検索を実行した。

データ件数

303,873ヒット

データ詳細
項目名 項目の説明
Query

blastX検索を行ったホウライシダEST配列のクローンID

BlastX Hits

UniProtKB/TrEMBL (release 39.9) データベースとの間でblastx検索を行い、ヒットした配列のAccessionとDefinition。 TogoDBでは、Uniprotへのリンク。

Align Length

上記ヒットした配列と、ホウライシダEST配列との間のアライメント長

Bit score

上記ヒットした配列と、ホウライシダEST配列との間のアライメントのScore (bit)

E-value

上記ヒットした配列と、ホウライシダEST配列との間のアライメントのE-value

Report

UniProtKB/TrEMBL(release 39.9)データベースとのblastx検索結果

UniProt ID

上記ヒットした配列のUniProt ID