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生命科学系データベースアーカイブ

RIKEN SSBC

試料調製

データ説明

info データ名 試料調製
info DOI 
info データ内容の説明 

ドメインの発現に用いるプラスミドの情報（タグ切断後の配列情報を含む）、発現条件、生成条件と収量。

info データファイル 
データファイル名:
riken_ssbc_sample.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/riken-ssbc/LATEST/riken_ssbc_sample.zip
ファイルサイズ:
8KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

-

info 解析方法 

-

info データ件数 

62件

データ詳細

項目名項目の説明
Plasmid プラスミドID
Domain ID ドメインID
Cleaved aaseq (切断処理後の)アミノ酸配列
MD ID MidiPrep ID
Domain name ドメイン名
Expression system 利用した発現システム
Scale 合成スケール (単位: ml)
Tube num 反応チューブ数（全体の合成スケールはscale*tube_num） (単位: 本数)
Temperature 反応温度 (単位: ℃)
Incubation time 反応時間 (単位: hour)
Plasmid conc プラスミド濃度 (単位: ul/ml)
Cofactor コファクター
Tag 切断処理の有無
Protease 切断処理に用いたプロテアーゼ
Affinity Affinity (AF) 精製用カラム
Ion-exchange イオン交換 (IEX) 精製用カラム
Gel filtration ゲルろ過 (GF) 精製用カラム
Protein conc タンパク質濃度 (単位: mg/ml)
Protein volume タンパク質収量 (単位: ul)
Label セレノメチオニンラベルの有無
Lot 精製ロット
Buffer バッファー組成
Purification date 精製終了年月日
PDB ID PDBID
Condition ID 結晶化条件ID