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このデータベースについて

tos17_insertion

データ説明
データ名
tos17_insertion
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00229-005.V001
バージョン
V1 10.18908/lsdba.nbdc00229-005.V001 -
データ内容の説明
各変異系統におけるTos17のイネゲノムリファレンス配列(日本晴、IRGSP-1.0)に対する挿入位置
データファイル
データファイル名 :
tos17_tos17_insertion.csv.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
751 KB
簡易検索URL
https://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/tos17_tos17_insertion#ja
データ取得方法

Tos17挿入隣接塩基配列(flanking)をIRGSP-1.0に対してBLASTN検索を行い、Tos17挿入位置を得た。

解析方法

-

データ件数

82790

データ詳細
項目名 項目の説明
Chromosome

染色体番号

Position

挿入位置

Direction

挿入方向

E-value

BLASTN検索のE値

Line name

系統名

Sequence Name

隣接塩基配列名