イネRFLP連鎖地図は以前作成した「A High-Density Rice Genetic Map 1998（高密度イネ遺伝地図1998）」のマーカーに1000近い新しいRFLPマーカーを加えた、3267のDNAマーカーを用いて構築しました。
追加マーカーのRFLP分析では、プローブとして、cDNA挿入断片全体よりもcDNAの3'非翻訳領域（UTR）を多く使用しました。このような場合、マーカー名はSの文字で終わります。挿入断片の目的の領域と同様に、3'UTR（非翻訳領域）を増幅するために、ユニバーサルプライマー「M13RV」と、3'末端の配列データを使って設計し得る適切な特異的プライマーを使用しました。
マーカーの命名と他の種々の詳細は「A High-Density Rice Genetic Map 1998（高密度イネ遺伝地図1998）」のデータに従っています。

表では、各染色体上での短腕のテロメア末端からの各マーカーの地図上の位置（遺伝的距離をcMで表示）、染色体番号、マーカー名、RFLP分析でプローブとして使用した挿入断片の5'末端と3'末端配列のDDBJ accession番号（入手可能な場合のみ）を表示します。
マーカーの位置関係の解析は、MAPMAKER/EXP 3.0で行いました。

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