項目名 | 項目の説明 |
PSCID |
データのID |
Classification |
6桁の数字からなる分類番号。各数字の意味は、左から以下の通りである。
- 1. リガンド結合と共役したドメイン運動のコンポーネント数
- 2. リガンド結合と独立なドメイン運動のコンポーネント数
- 3. リガンド結合と共役したローカル運動のコンポーネント数
- 4. リガンド結合と独立なローカル運動のコンポーネント数
- 5. リガンドが埋没したドメイン数
- 6. 表面にリガンド分子が結合したドメイン数
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Protein name |
タンパク質名 |
FreeID |
リガンドと結合していない立体構造(PDB ID) |
BoundID |
リガンド結合した立体構造(PDB ID) |
Ligands |
リガンド名(PDB) |
EC |
EC番号(酵素番号) |
Distance |
酵素活性部位(Catalytic Site Atlas(CSA))とリガンド結合部位の距離 |
Component No |
運動のコンポーネント番号 |
Type of motion |
運動の種類 |
Ligand binding |
リガンド結合の種類 |
Type of coupled motion |
リガンド結合と共役した運動の種類 |
Order-disorder transition |
ディスオーダー領域の有無("Yes"または空白) |
RMSD |
ドメイン運動の平均二乗平方根変位量 |
Mean displacement |
ローカル運動の平均変位量 |
C.C. |
線形応答理論によって予測された変位ベクトルと、結晶構造で実際に観測された変位ベクトルとの相関係数 |
Crystal packing |
結晶場の影響により誘起された運動の有無("Coupled"または空白) |
Fixed segment |
固定した運動部位 |
Moving segment |
可動する運動部位 |
Disorder |
ディスオーダー残基数 |
Helix/coil |
ヘリックス/コイル転移する残基数 |
Open state |
結晶場の影響による開閉運動の区分 |
H-bonds/ligand |
リガンド埋没運動に分類されたタンパク質とリガンドの水素結合の数 |
H-bonds/water |
リガンド埋没運動に分類されたタンパク質と水分子の水素結合の数 |
H-bonds/protein |
リガンド埋没運動に分類されたタンパク質の水素結合の数 |