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PSCDB
PSCIDリスト
データ説明
データ名
PSCIDリスト
DOI
10.18908/lsdba.nbdc01636-001
データ内容の説明
PSCIDと、各エントリの共通項目のリスト
データファイル
データファイル名:
pscdb_pscid_list.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/pscdb/LATEST/pscdb_pscid_list.zip
ファイルサイズ:
24.4 KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/pscdb_pscid_list
データ取得方法
PDB
解析方法
-
データ件数
839 件
データ詳細
項目名
項目の説明
PSCID
データのID
Classification
6桁の数字からなる分類番号。各数字の意味は、左から以下の通りである。
1. リガンド結合と共役したドメイン運動のコンポーネント数
2. リガンド結合と独立なドメイン運動のコンポーネント数
3. リガンド結合と共役したローカル運動のコンポーネント数
4. リガンド結合と独立なローカル運動のコンポーネント数
5. リガンドが埋没したドメイン数
6. 表面にリガンド分子が結合したドメイン数
Protein name
タンパク質名
FreeID
リガンドと結合していない立体構造(PDB ID)
BoundID
リガンド結合した立体構造(PDB ID)
Ligands
リガンド名(PDB)
EC
EC番号(酵素番号)
Distance
酵素活性部位(Catalytic Site Atlas(CSA))とリガンド結合部位の距離
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