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このデータベースについて

トラップされた遺伝子に関する情報

データ説明
データ名
トラップされた遺伝子に関する情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00961-001
データ内容の説明
ES細胞クローンでトラップされた遺伝子の情報と、回収されたcDNA断片の塩基配列。
データファイル
データファイル名 :
naistrap_db.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
107KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/naistrap_db
データ取得方法

poly-A trap 型ベクターによってランダムに遺伝子をトラップし、 その cDNA 断片を 3’ RACE 法(特殊な PCR 技術)を用いて増幅して塩基配列を得ている

解析方法

3' RACE により得られた塩基配列を用いて BLAST検索等を実施し、トラップした遺伝子を特定している。

データ件数

585件

データ詳細
項目名 項目の説明
Clone number

クローン番号

Trapped gene

トラップ(破壊)された配列の相同性検索結果のトップヒットの遺伝子情報

Expression in ES cells

ES細胞での遺伝子発現 NT: not tested

Identity

トラップされた遺伝子の塩基配列の相同性検索結果のトップヒットのIdentity

CDS in mRNA

mRNA内のコーディング領域

Deleted region

欠失のおきた領域

Trapped seq

トラップされた塩基配列