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生命科学系データベースアーカイブ

jPOSTデータベース

PSMペプチドデータ

データ説明

info データ名 PSMペプチドデータ
info DOI 
info データ内容の説明 

protein spectrum matchで得られたペプチドのデータ。

info データファイル 
データファイル名:
jpostdb_psm.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/jpostdb/LATEST/jpostdb_psm.zip
ファイルサイズ:
64.6MB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

protein spectrum match

info 解析方法 -
info データ件数 

4936877

データ詳細

項目名項目の説明
psm_id jPOST内部のPSM ID
sequence ペプチド配列
accession UniProt ID
exp_mz 実験により得られたm/z(質量ｍと電荷zの比)値
calc_mz 計算により求められたm/z(質量ｍと電荷zの比)値
charge 電荷
jpost_score jPOSTスコア