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生命科学系データベースアーカイブ
jPOSTデータベース

同定タンパク質データ

データ説明

info データ名 同定タンパク質データ
info DOI 
info データ内容の説明 

jPOSTリポジトリ上のプロテオームデータを再解析し、UniProt上のタンパク質データと同定した結果のサマリデータ。

info データファイル 
データファイル名:
jpostdb_protein.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/jpostdb/LATEST/jpostdb_protein.zip
ファイルサイズ:
11.8MB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 -
info 解析方法 -
info データ件数 

530455

データ詳細

項目名項目の説明
protein_id jPOST内部のタンパク質ID
accession UniProt ID
symbol UniProt タンパク質シンボル
name タンパク質名
protein_type タンパク質の種類（Leading protein, Spectrum same-set protein Spectrum sub-set protein, Spectrum subsumable protein）
pep_count 同定されたペプチドの総数
psm_count peptide specrum match(マススペクトルでマッチしたペプチド)の総数
uniq_pep_count ユニークなペプチドの総数