同定タンパク質データ

データ名

同定タンパク質データ

DOI

データ内容の説明

jPOSTリポジトリ上のプロテオームデータを再解析し、UniProt上のタンパク質データと同定した結果のサマリデータ。

データファイル

データファイル名:

jpostdb_protein.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

11.8MB

簡易検索URL

データ取得方法

解析方法

データ件数

530455

項目名	項目の説明
protein_id	jPOST内部のタンパク質ID
accession	UniProt ID
symbol	UniProt タンパク質シンボル
name	タンパク質名
protein_type	タンパク質の種類（Leading protein, Spectrum same-set protein Spectrum sub-set protein, Spectrum subsumable protein）
pep_count	同定されたペプチドの総数
psm_count	peptide specrum match(マススペクトルでマッチしたペプチド)の総数
uniq_pep_count	ユニークなペプチドの総数

このデータベースについて