分子情報

データ名

分子情報

DOI

バージョン

V2	10.18908/lsdba.nbdc00495-001.V002	更新履歴
V1	10.18908/lsdba.nbdc00495-001.V001	-

データ内容の説明

2012年までに登録されたPDBエントリから、水素を含む構造（中性子回折による構造と、分解能1.0Å以下のX線回折による構造）を自動選択し、情報を自動抽出。

データファイル

データファイル名:

hhdb_biomolecule.zip

データのURL:

ファイルサイズ:

9KB

簡易検索URL

データ取得方法

PDB (Protein Data Bank)

解析方法

登録されたPDBエントリから、水素を含む構造（中性子回折による構造と、分解能1.0Å以下のX線回折による構造）を自動選択し、情報を自動抽出

データ件数

97件

項目名	項目の説明
Molecule No.	分子番号（オリジナルDBとアーカイブでは異なるものがあるので注意）
Molecule Name	分子名称
Molecule Classification	PROTEIN, DNA等の分類
Wild/Mutant	野生型・変異型の別
PDB ID	データ処理対象分子のPDB ID
Resolution	分解能（Å）
Lattice Constant A	格子定数(a)
Lattice Constant B	格子定数(b)
Lattice Constant C	格子定数(c)
Lattice Constant alpha	格子定数(alpha)
Lattice Constant beta	格子定数(beta)
Lattice Constant gamma	格子定数(gamma)
Space Group	空間群
Z value	Z値
Experimental Method	実験手法 (NEUTRON: 中性子回折、X-RAY: Ｘ線回折)
Authors	著者(コンマ区切り)
Deposited	PDBに登録された日
Released	PDBで公開された日
Access Code	アクセスコード
Registration	HHDBに登録された日時
No Hydrogen	水素原子なしの場合はTRUE(t)
Hbonds	水素結合の数
HBondsSym	対称分子に対する水素結合の数
Atoms	原子数
H Atoms	水素原子の数
Waters	水分子の数

このデータベースについて