- あのデータベースが、丸ごとダウンロード可能に!-
このデータベースについて

分子情報

データ説明
データ名
分子情報
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00495-001.V002
バージョン
V2 10.18908/lsdba.nbdc00495-001.V002 更新履歴
V1 10.18908/lsdba.nbdc00495-001.V001 -
データ内容の説明
<span style="color: #000000;" color="red">2012</span>年までに登録されたPDBエントリから、水素を含む構造(中性子回折による構造と、分解能1.0Å以下のX線回折による構造)を自動選択し、情報を自動抽出。
データファイル
データファイル名 :
hhdb_biomolecule.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
9KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/hhdb_biomolecule
データ取得方法

PDB (Protein Data Bank)

解析方法

登録されたPDBエントリから、水素を含む構造(中性子回折による構造と、分解能1.0Å以下のX線回折による構造)を自動選択し、情報を自動抽出

データ件数

97件

データ詳細
項目名 項目の説明
Molecule No.

分子番号(オリジナルDBとアーカイブでは異なるものがあるので注意)

Molecule Name

分子名称

Molecule Classification

PROTEIN, DNA等の分類

Wild/Mutant

野生型・変異型の別

PDB ID

データ処理対象分子のPDB ID

Resolution

分解能(Å)

Lattice Constant A

格子定数(a)

Lattice Constant B

格子定数(b)

Lattice Constant C

格子定数(c)

Lattice Constant alpha

格子定数(alpha)

Lattice Constant beta

格子定数(beta)

Lattice Constant gamma

格子定数(gamma)

Space Group

空間群

Z value

Z値

Experimental Method

実験手法 (NEUTRON: 中性子回折、X-RAY: X線回折)

Authors

著者(コンマ区切り)

Deposited

PDBに登録された日

Released

PDBで公開された日

Access Code

アクセスコード

Registration

HHDBに登録された日時

No Hydrogen

水素原子なしの場合はTRUE(t)

Hbonds

水素結合の数

HBondsSym

対称分子に対する水素結合の数

Atoms

原子数

H Atoms

水素原子の数

Waters

水分子の数