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このデータベースについて

日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度

データ説明
データ名
日本人におけるマイクロサテライトマーカーのヘテロ接合度
DOI
10.18908/lsdba.nbdc00171-001
データ内容の説明
<a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12053178" rel="external">Kong A et al. Nat. Genet. 2002 Jul;31(3):241-7.</a>に記載された4,868マイクロサテライトマーカーについて,日本人32検体の遺伝子型を取得し,アレル頻度よりヘテロ接合度を算出した。
データファイル
データファイル名 :
heterozygosity_jp.zip
データのURL :
ファイルサイズ :
113KB
簡易検索URL
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/heterozygosity_jp
データ取得方法

キャピラリーシーケンサー

解析方法

-

データ件数

5,037件

データ詳細
項目名 項目の説明
Marker name

マーカー名。 簡易検索ではNCBI UniSTSへのリンク。

Marker name (Also known as)

マーカー名 (別称)。簡易検索ではNCBI UniSTSへのリンク。

Chromosome

染色体の番号

Position

染色体上の位置

Position (bp) UCSC 2006 Mar, 2004 Jul*, 2003 May**

UCSCによる染色体上の位置 (bp) *は2004 Jul.、**は2003 May、それ以外は2006 Mar.のバージョン。

No. of Alleles (observed)

アレル数

Het

ヘテロ接合度

Position (cM) Genethon

Genethon社による染色体上の位置 (cM)

Position (cM) Marshfield

Marshfield社による染色体上の位置 (cM)

Position (cM) deCODE

deCODE Genetics社による染色体上の位置 (cM)

Repeat Unit

リピート長

Gene (markers in intron or UTR)

遺伝子記号 (イントロンもしくはUTRにマーカーが存在する場合)

Linkage set

連鎖解析のために選ばれたマーカーに*を付与している。