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生命科学系データベースアーカイブ

GRIPDB

予測情報

データ説明

info データ名 予測情報
info DOI 
info データ内容の説明 

予測されたGPCR相互作用部位情報

info データファイル 
データファイル名:
gripdb_predicted_info.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/gripdb/LATEST/gripdb_predicted_info.zip
ファイルサイズ:
219 KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

PDB, RefSeq

info 解析方法 -
info データ件数 

36,450 件

データ詳細

項目名項目の説明
ID 予測情報のID
GRIP ID 関連する相互作用のGRIP ID
Prediction No 予測番号（GRIP IDの中の連番）
Template GRIP IDのインターフェイスの参照構造
Target GPCRのアミノ酸配列ID
Template Pos インタフェースの参照構造における残基開始位置
Template Seq インタフェースの参照構造における残基終了位置
Target Pos インタフェースのGRIP IDにおける残基開始位置
Target Seq インタフェースのGRIP IDにおける残基終了位置
CONS(i) 保存度
Article 参照文献(PubMed ID)