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生命科学系データベースアーカイブ

GDBS

SNPs Typing: SNP Information

データ説明

info データ名 SNPs Typing: SNP Information
info DOI 
info データ内容の説明 

個別タイピングによる実験により絞り込まれた領域に存在するSNPのデータ。

info データファイル 
データファイル名:
hgold_snp_info.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/gdbs/LATEST/hgold_snp_info.zip
ファイルサイズ:
76.7 KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

-

info 解析方法 

-

info データ件数 

3,807件

データ詳細

項目名項目の説明
Group SNPのグループ
SNP ID SNPのID
Chromosome SNPの存在する染色体の番号
Strand SNPの向き
Start Position SNPの染色体上の開始位置
End Position SNPの染色体上の終了位置
Cytoband SNPの存在する染色体上の位置
Gene SNPの存在する遺伝子名
Gene Strand 遺伝子の向き
Allele 対立するSNP配列の組み合わせ
Sequence SNPの周辺配列
Validation Status dbSNPのValidation Status番号
SNP Class dbSNPのSNP Class番号
Polymorphism 対立するSNP配列の組み合わせ（Alleleと同じ）
Molecule Type dbSNPのMolecule Type
Link to Hardy Weinberg Test HWTへのリンク
Link to Statistics Statisticsへのリンク