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生命科学系データベースアーカイブ

FANTOM5

Results of de-novo and Motif activity analyses

データ説明

info データ名 Results of de-novo and Motif activity analyses
info DOI 
info バージョン 
V3更新なし
V2更新なし
V1-
info データ内容の説明 

転写開始点領域近傍における転写因子結合部位モチーフの解析結果。

  • HOMER等による de novoモチーフ解析
  • de novo モチーフや既知転写因子結合モチーフ(JASPARに登録されているもの)と、CAGEで測定された転写開始活性との相関に関する有意性
info データファイル 
データファイル名:
Motifs
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/fantom5/datafiles/phase1.3/extra/Motifs/
ファイルサイズ:
6.2 GB
info 簡易検索URL -
info データ取得方法 -
info 解析方法 

JASPER モチーフ探索
HOMER モチーフ解析

info データ件数 

400 ファイル

データ詳細

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