データ説明 | |
コンティグ配列とそのアノテーション(アミノ酸配列、相同性検索結果)、及び発現プロファイル | |
10.18908/lsdba.nbdc00419-002 | |
細胞性粘菌Dictyostelium discoideumのcDNA配列のコンティグ配列とそのアノテーション(アミノ酸配列、相同性検索結果(ターゲットDB:コンティグ配列-DB、 DNA-DB、タンパク質-DB)) コンティグ配列は、5'EST配列、3'EST配列、5'ESTと3'ESTを連結した配列、及び全長cDNA配列をアセンブルプログラム Phrap(http://www.phrap.org/index.html)によって、アセンブルすることによって得られた。 コンティグを構成するクローンリストへのリンク、コンティグ配列のゲノム配列へのマッピング情報、及び相同性検索結果のトップ10ヒットのリストがある。 また、コンティグを構成するクローンのライブラリー毎の数を、5種類の発生段階、14種類のライブラリーについて記載した。 ライブラリー特異的なクローンを検索することが可能である。CSV形式のテキストファイル。 | |
http://togodb.biosciencedbc.jp/togodb/view/dicty_cdb_contig | |
- | |
EST配列をPhrapでアセンブルした。 | |
8,402件 | |
データ詳細 | |