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生命科学系データベースアーカイブ

DIAM - 微生物情報

中間データH12 (酵母の化学成分情報)

データ説明

info データ名 中間データH12 (酵母の化学成分情報)
info DOI 
info データ内容の説明 

DIAM-微生物情報の前身となるデータベースで公開していた同定・分類関連情報 （詳細はデータベースの説明の背景・プロジェクト欄の「中間データH12」の説明を参照のこと）。酵母の化学成分情報を含む。DIAM-微生物情報に登録されていた生物種名(Taxonomy ID) と対応するエントリーのみ、生物種リストの「同定・分類」項目にリンクをしている。
Excel版のReference No.に対応する出典情報については、J2-分類同定用文献.xlsを参照のこと。

info データファイル 
データファイル名:
diam_microbe_previous_ident2.zip
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/diam-microbe/LATEST/diam_microbe_previous_ident2.zip
ファイルサイズ:
8.1KB
データファイル名:
yeast.zip (Excel形式)
データのURL:
https://dbarchive.biosciencedbc.jp/data/diam-microbe/LATEST/yeast.zip
ファイルサイズ:
19.8KB
info 簡易検索URL 
info データ取得方法 

調査、検索

info 解析方法 

専門家会合等で妥当性を検討

info データ件数 

201件

データ詳細

項目名項目の説明
Species
【Excel版では、Genus, Species, Sub-species/ varietyの項目に分かれる。】		 生物種の名称
Taxonomy ID NCBIのTaxonomy Browser ID
Strain
【Strain No.】		 株の名称
基準株
【Status of strain】		 基準株であることを示す印として、"T"と記入している。
キノン組成
【Quinone (Composition)】		 キノンの種類
出典 (キノン組成)
【Quinone (Reference No.)】		 キノンの参照文献
G＋C含量 (Low)
【G+C (Low)】		 収集した文献データにおける記述のG+C含量にばらつきがあるときの、最小値
G＋C含量 (High)
【G+C (High)】		 収集した文献データにおける記述のG+C含量にばらつきがあるときの、最大値
G＋C含量測定法
【G+C (Method)】		 G＋C含量測定法
出典 (G＋C含量)
【G+C (Reference No.)】		 G＋C含量情報の参照文献
細胞壁糖組成
【細胞壁 (糖組成)】		 細胞壁糖組成
出典 (細胞壁糖組成)
【Reference No.】		 細胞壁糖組成の参照文献
菌体糖組成
【菌体糖組成 (糖名）】		 菌体糖組成
出典 (菌体糖組成)
【菌体糖組成 (Reference No.)】		 菌体糖組成の参照文献
アルカリ抽出多糖
【ｱﾙｶﾘ抽出多糖 (糖名）】		 アルカリ抽出多糖
出典 (アルカリ抽出多糖)
【ｱﾙｶﾘ抽出多糖 (Reference No.)】		 アルカリ抽出多糖の参照文献

* 【】は、Excel版の項目名