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項目名 項目の説明
Accession Number (アクセッション番号)

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Soil Icon

土壌群と土地利用を記号で表示

Denaturing Gradient Gel Electrophoresis (DGGE)

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DNA Marker Information (対象マーカー情報)

marker for bacterium, fungas, nematodeから選択

Lane Number (レーン番号)

DGGEゲル画像におけるレーン番号(左側から)

Quality (精度)

精度

DGGE Gel Image

DGGEゲル画像

Associated Data (関連データ)

-

Repeat Data (反復データ)

反復データがある場合に表示

Microorganisms (微生物)

他の微生物を対象としたデータがある場合に表示

Diversity Index (多様性指数)

-

Richness (R) (種の豊富さ)

種の豊富さ

Shannon index (H’) (シャノン指数)

シャノン指数

Simpson index (1-D) (シンプソン指数)

シンプソン指数

Sample Registration (サンプル登録)

-

Collector (採取者名)

採取者名

Affiliation (所属名)

所属名

Sampling Date (採取年月日)

採取年月日

Experimental Purpose (試験目的)

-

Experimental Purpose (試験目的)

例)肥料と収量の関係

Experimental Plan (試験設計)

-

Soil Moisture Content (土壌水分(生土あたりの含水量))

土壌水分(生土あたりの含水量)

Sample Information (サンプル情報)

-

Sample Information (サンプル情報)

DNA情報に相当するサンプルの情報 例)X処理のZ区の反復2番目

Experimental Plot (試験区面積)

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Sampling Site (採取場所)

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Latitude (緯度(北緯)) * 非公開にしました(2019/10/17)

緯度(北緯)

Longitude (経度(東経)) * 非公開にしました(2019/10/17)

経度(東経)

Location * 非公開にしました(2019/10/17)

サンプルの採取場所を示すGoogle Mapsへのリンク

Note (備考)

備考

Origin (由来)

-

Origin (由来)

non-rhizosphere(非根圏)、rhizosphere(根圏)、その他から選択

Note (備考)

備考

Soil Groups (土壌群)

-

Soil Groups (土壌群)

農耕地土壌分類(第3次案)の24群から選択

Land Use (土地利用)

-

Land Use (土地利用)

田、普通畑、樹園地(果樹園・茶園)、草地(牧草地・放牧地等)、その他(耕作放棄地・非農耕地)から選択

Soil Texture (土性)

土性11項目から選択

pH (pH (風乾土))

pH (風乾土)

EC (EC)

EC

Total C (炭素含有率)

炭素含有率

Total N (窒素含有率)

窒素含有率

Soil Biomass (土壌バイオマス)

微生物バイオマス量

Available P (可給態P)

トルオーグリン酸

Nitrogen Mineralization Rate (窒素無機化量)

培養法(土壌標準分析測定法に準ずる)

Cation Exchange Capacity (CEC) (陽イオン交換容量)

陽イオン交換容量

The Others (その他)

その他

Crop (栽培作物)

-

Crop (作物名)

作物名

Cultivar (品種)

品種

Planting Density (1) (栽植密度)

密度(本/m2)

Planting Density (2) (栽培様式)

畝間 or 条間(cm)×株間(cm)

Note (備考)

備考

Organic Fertilizer (有機質肥料)

-

Kind of Organic Material (有機物の種類)

有機物の種類

Rate of Application (施用量)

施用量

Year of Continuous Application (連用年数)

連用年数

Time of Fertilizer Application (施用時期)

春、夏、秋、冬から選択

Chemical Fertilizer (化学肥料)

-

Kind of Fertilizer (肥料の種類)

肥料の種類

Rate of Fertilizer Application (施用量)

施用量

Year of Continuous Application (連用年数)

連用年数

Time of Fertilizer Application (施用時期)

春、夏、秋、冬から選択

Pesticide Application (薬剤散布)

-

Kind of Pesticide (薬剤の種類)

薬剤の種類

Rate of Pesticide Application (施用量)

施用量

Year of Continuous Application (連用年数)

連用年数

Time of Pesticide Application (施用時期)

春、夏、秋、冬から選択

Water Management (水管理)

-

Water Management (水管理)

水管理

Experimental Result (試験結果)

-

Experimental Result (試験結果)

調査データ(収量、病害発生等)

Cultivation History (栽培暦)

-

Former Cultivated Crop (前作物名)

前作物名

Seeding or Transplanting Date (作業日)

播種日または移植日(裸地などの場合はNDと記入)

Harvest Date (収穫日)

収穫日

Temperature (気温)

-

Temperature (気温)

気温

DNA Sequence (DNA)

-

DNA Extraction Methods (抽出法)

スタンダード法か、独自法か選択

Sample Name (サンプル名)

サンプル名

Target DNA (種類)

例)16S rDNA

Note (備考)

備考

Gradient of Denaturing Agent (変性剤濃度勾配)

変性剤濃度勾配

Run Voltage (泳動電圧)

泳動電圧

Run Time (泳動時間)

泳動時間

Run Temperature (泳動温度)

泳動温度

Amount of Sample DNA (泳動DNA量)

泳動DNA量

Note (備考)

備考

Download

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DGGE Gel Image

DGGEゲル画像

Environmental Data

環境データ

All Data

全データ

Accession Number (アクセッション番号)

管理者が指定する土壌登録番号
*Accession Numberの識別
・ハイフン前方の6桁の数字が同じ場合、同一反復(処理)区かつ同一採取日のサンプルであることを示す ・ハイフン後方について 例)001531-1, 001531-2・・・ 1処理区の2反復   001533-0 ・・・ 反復のない場合   001534-a, 001534-b ・・・ 1処理区内の2サブサンプル   001536-1a, 001536-1b ・・・ 1反復内の2サブサンプル   001538-1* ・・・ *はその反復(処理区)を代表するサンプルであることを示す   001539-1.1, 001539-1.2 ・・・ドットの後の数字は、1反復(処理区)の土からDNA抽出を複数回 行った場合の識別   001541-1.mix ・・・ ドットの後の「mix」表示は、同じ土からとった複数のDNA抽出サンプルを 混合した場合の識別   001542-1.repeat ・・・ ドットの後の「repeat」表示は、既に同一サンプルを登録してある場合の識別

Experimental Plan (試験設計)

例)X区=A処理×B処理×C反復、あるいは現地調査A地点の反復サンプルCなどのように

Experimental Plot (試験区面積)

試験区面積

Physical and Chemical Properties of Soil (土壌物理化学性)

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Soil Respiration Activity (土壌呼吸活性)

土壌呼吸活性

Other Related Date (その他関連データ)

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