| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| dna update |
公共データベースのDNA配列との相同性検索の更新日 |
| IDs and Links |
- |
| Clone ID |
cDNAクローンのID |
| Atlas ID |
Atlas データベース（リンク）のID、Atlas データベースへのリンク |
| dictyBase ID |
dictyBase（http://dictybase.org/）のProtein Coding GeneのID。TogoDB版には、dictyBaseへのリンク。 |
| Link to Contig |
ESTが含まれるコンティグへのリンク（TogoDB版のみ） |
| Representative Seq. and Annotation |
- |
| Representative seq. ID |
相同性検索に使用したDNA配列のID。１）全長cDNA配列、２）5'ESTと3'ESTを連結した配列、３）5'EST配列、４）3'EST 配列の中から、１）、２）、３）、４）の優先順位で選択し、代表DNA配列とした。 |
| Representative DNA sequence |
代表DNA配列 |
| sequence update |
代表DNA配列の更新日 |
| Translated Amino Acid sequence (All Frames) |
代表DNA配列の6フレームを翻訳したアミノ酸配列。 |
| own update |
CSM（クローン配列の集合）との相同性検索の更新日 |
| Homology vs DNA |
公共データベースのDNA配列とのblastn検索のトップ10ヒットのリスト |
| Homology vs Protein |
公共データベースのタンパク質配列とのblastx検索のトップ10ヒットのリスト |
| protein update |
公共データベースのタンパク質配列との相同性検索の更新日 |
| PSORT |
タンパク質細胞内局在予測プログラムPSORT（http://psort.ims.u-tokyo.ac.jp/）の実行結果 |
| Seqeunces |
- |
| 5' end seq. ID |
5'EST配列のID。ID末尾に"F"がつく。 |
| 5' end seq. |
5'EST配列。FASTA形式。 |
| Length of 5' end seq. |
5'EST配列の長さ。 |
| 3' end seq. ID |
3'EST配列のID。ID末尾に"Z"がつく。 |
| 3' end seq. |
3'EST配列。FASTA形式 |
| Length of 3' end seq. |
3'EST配列の長さ。 |
| Connected seq. ID |
5'ESTと3'ESTを連結した配列のID。ID末尾に"P"がつく。 |
| Connected seq. |
5'ESTと3'ESTを10個のギャップ(-)で連結した配列 |
| Length of connected seq. |
5'ESTと3'ESTを連結した配列の長さ。（ギャップ(-)は除く） |
| Full length Seq ID |
全長cDNAのID。ID末尾に"E"がつく。 |
| Full length Seq. |
全長cDNA配列。FASTA形式。 |
| Length of full length seq. |
全長cDNAの長さ。 |
| Library |
配列が得られた５種類の発生段階に由来する14種類（AF, AH, CF, CH, FC, FC-IC, FCL, SF, SH, SL, SS, VF, VH, VS）のcDNAライブラリー。 |
| NBRP ID |
ナショナルバイオリソースプロジェクト (NBRPリンクにする)で提供されている全長ORFをカバーするcDNAクローンのID。 TogoDB版には「ナショナルバイオリソースプロジェクト (NBRP)細胞性粘菌」の遺伝子データベース （http://nenkin.lab.nig.ac.jp/genes）へのリンク。 |
| Translated Amino Acid sequence |
代表DNA配列を翻訳したアミノ酸配列。 |
| Homology vs CSM-cDNA |
dicty_cDBのクローン配列とのblastn検索のトップ10ヒットのリスト |