| 項目名 | 項目の説明 |
|---|---|
| Contig information |
- |
| Contig ID |
コンティグ配列のID |
| Contig update |
配列の更新日 |
| Contig sequence |
コンティグ配列。 |
| Gap |
コンティグにギャップ(-)が含まれるかの有無。 -ギャップを含む: gap included -ギャップを含まない: no gap |
| Contig length |
コンティグの長さ |
| Chromosome number (1..6, M) |
コンティグがマップされた染色体番号。マップされた場合は、1から6、またはM(ミトコンドリア)が値となる。 |
| Chromosome length |
コンティグがマップされた染色体の長さ |
| Start point |
コンティグがマップされた開始位置 |
| End point |
コンティグがマップされた終点位置 |
| Strand (PLUS/MINUS) |
コンティグがマップされた向き (PLUS/MINUS) |
| Number of clones |
コンティグを構成するクローンの数 |
| Number of EST |
コンティグを構成するESTの数 |
| Link to clone list |
コンティグを構成するクローン全体のTogoDB版へのリンク。TogoDB版のみ、クローンリストへのリンク有り。 |
| List of clone(s) |
コンティグを構成するクローンの一覧。TogoDB版のみ、各クローンへのリンク有り。 |
| Annotation |
- |
| Translated Amino Acid sequence |
DNA配列を翻訳した代表のアミノ酸配列。 |
| Translated Amino Acid sequence (All Frames) |
DNA配列の6フレームを翻訳したアミノ酸配列。 |
| own update |
dicty_cDBのコンティグ配列とのblastn検索の更新日 |
| Homology vs CSM-cDNA |
dicty_cDBのコンティグ配列とのblastn検索結果のトップ10ヒットのリスト |
| dna update |
公共データベースのDNA配列とのblastn検索の更新日 |
| Homology vs DNA |
公共データベースのDNA配列とのblastn検索結果のトップ10ヒットのリスト |
| protein update |
公共データベースのタンパク質配列とのblastx検索の更新日 |
| Homology vs Protein |
公共データベースのタンパク質配列とのblastx検索結果のトップ10ヒットのリスト |
| PSORT |
タンパク質細胞内局在予測プログラムPSORT(http://psort.ims.u-tokyo.ac.jp/)の実行結果 |
| Expression profile |
- |
| VS (DIR, S) |
コンティグを構成するVS由来のクローンの数 |
| VH (FL, L) |
コンティグを構成するVH由来のクローンの数 |
| VF (FL, S) |
コンティグを構成するVF由来のクローンの数 |
| AH (FL, L) |
コンティグを構成するAH由来のクローンの数 |
| AF (FL, S) |
コンティグを構成するAF由来のクローンの数 |
| SL (DIR, L) |
コンティグを構成するSL由来のクローンの数 |
| SH (FL, L) |
コンティグを構成するSH由来のクローンの数 |
| SF (FL, S) |
コンティグを構成するSF由来のクローンの数 |
| CH (FL, L) |
コンティグを構成するCH由来のクローンの数 |
| CF (FL, S) |
コンティグを構成するCF由来のクローンの数 |
| FCL (DIR, L) |
コンティグを構成するFCL由来のクローンの数 |
| FC (DIR, S) |
コンティグを構成するFC由来のクローンの数 |
| FC-IC (SUB) |
コンティグを構成するFC-IC由来のクローンの数 |
| SS (DIR, S) |
コンティグを構成するSS由来のクローンの数 |